中国南方汉族人群HLAⅡ类基因多态性与原发性IgA肾病的关联研究

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IgA肾病(IgA Nephropathy)是以肾小球系膜区IgA沉积为主要病理特征的一组原发性肾小球疾病,也是我国和远东地区最常见的原发性肾小球疾病,是肾活检的首位病因。IgA肾病的发病机制至今尚未完全明了,从已有的研究结果来分析,免疫因素、遗传因素、环境因素及炎症介质等多种因素均参与了IgA肾病的发生和发展,而遗传因素可能在此病的发生发展中起重要作用。根据流行病学调查资料、家族性IgA肾病的发现、IgA肾病的家族聚集现象、IgA肾病相关基因或致病基因的发现等证据显示,IgA肾病是一种多基因遗传病(polygenic inheritance disorders),其发生、发展与多种基因变异有关。 HLA Ⅱ类基因不仅是重要的人类遗传学标志,且在提呈外源性抗原给CD4+T淋巴细胞,启动体液免疫反应等过程中起关键作用。HLA Ⅱ类基因也被认为是主要的IgA肾病相关或易感基因之一。国外关于HLA基因多态性与IgA肾病的研究开始于上世纪70年代中期,国内的相关研究相对较少,主要集中在华北和华东地区。这些研究多采取血清学、PCR-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)、PCR-序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SSO)、PCR-序列特异性引物(PCR-SSP)等方法进行,且所得相关或易感等位基因并不一致。 本课题组于2006年开始对中国南方汉族人群HLA Ⅱ类基因多态性与IgA肾病的关系展开研究,主要采用PCR-直接测序分型(PCR-SBT)的检测方法。前期的研究结果提示HLA-DPB1*0501与IgA肾病的发病显著相关,可能是其易感基因,而HLA-DPB1*030101、和HLA-DPB1*1301则可能是其保护基因。本研究继续采用病例.对照研究的关联分析方法对HLA Ⅱ类基因及其调控区多态性进行分析,以进一步明确中国南方汉族人群IgA肾病的易感和(或)保护基因,为IgA肾病的早期发现、早期诊断和早期治疗提供依据。 第一章 中国南方汉族人群HLA-DPB1基因多态性与IgA肾病的关联研究   目的:扩大样本量,继续采用PCR-SBT分型方法进行HLA-DPB1基因多态性与IgA肾病的关联研究,明确中国南方汉族人群IgA肾病易感和(或)保护基因,并结合临床表现和病理类型等进行相关分析。 结果:在全部IgA肾病患者和健康对照中,共发现36种HLA-DPB1等位基因,IgA肾病患者中有22种。其中HLA-DPB1*0501在患者组的基因频率较高,达到58.47%,与健康对照(46.71%)相比具有统计学差异(p=0.005, OR=1.606)。HLA-DPB1*1401在患者组的基因频率亦显著高于健康对照(p=0.042,OR=1.006)。而HLA-DPB1*020102和HLA-DPB1*030101在患者组的基因频率显著低于健康对照(p=0.037,OR=0.544;p=0.007,OR=0.100)。在临床分组中,HLA-DPB1*0202在高血压组的分布显著低于血压正常组(p=0.039,OR=0.236);而HLA-DPB1*020102在肾功能不全组的分布显著低于肾功能正常组(p=0.019,OR=0.127)。HLA-DPB1*020102在Haas分级Ⅱ-Ⅲ级组和Ⅳ-Ⅴ 第二章 中国南方汉族人群HLA-DPB1基因调控区单核苷酸多态性(SNPs)与IgA肾病的关联研究   目的:采用PCR-直接测序方法进行HLA—DPB1基因调控区多态性与IgA肾病的关联研究,并结合临床表现和病理类型等进行相关分析。 方法:收集214例原发性IgA肾病患者临床和病理资料以及全血标本,收集190例与患者性别、年龄均匹配的健康对照组全血标本。采用QIAamp DNA Blood Midi Kit试剂盒提取基因组DNA。并根据人类基因组DPB1基因全序列设计特异性PCR引物DPBRF和DPBRR,应用PCR-直接测序和克隆测序等方法进行HLA-DPB1调控区SNPs分析。根据血压、24小时尿蛋白定量、血清IgA水平、肉眼血尿、肾功能、肾组织学病变程度(Haas分级)分别对患者进行分组,计算并比较各配对组SNPs位点的分布频率差异。 结果:在全部IgA肾病患者和健康对照中,共发现5个HLA-DPB1基因调控区SNPs位点,分别为-230C/G、-224 C/A、-183T/C、-116T/C和-64C/A位点,其中-64C/A是dbSNP数据库和IGMT/HLA数据库尚未报道的位点。而5个SNPs位点在两组中的分布频率均无显著差异(p>0.05)。根据临床表现、Haas病理分级分组进行的SNPs分布频率比较,亦均无统计学差异。 结论:HLA-DPB1基因调控区SNPs与IgA肾病的发病可能不相关。 第三章 中国南方汉族人群HLA-DRB1基因多态性与IgA肾病的关联研究   目的:采用巢式PCR-SBT分型方法进行HLA-DRB1基因多态性与IgA肾病的关联研究,明确中国南方汉族人群IgA肾病易感和(或)保护基因,并结合临床表现和病理类型等进行相关分析。 方法:收集139例原发性IgA肾病患者临床和病理资料及全血标本,以及143例与患者性别、年龄均匹配的健康对照组全血标本。采用QIAamp DNA Blood Midi Kit试剂盒提取基因组DNA,并根据人类基因组DRB1基因全序列和DRB1等位基因数据库设计特异性PCR引物,包括第一轮1对引物和第二轮12对引物,进行巢式PCR,随后进行PCR产物直接测序或克隆后测序等方法进行基因分型。根据血压、24小时尿蛋白定量、血清IgA水平、肉眼血尿、肾功能、肾组织学病变程度(Haas分级)分别对患者进行分组,计算并比较各配对组基因型的分布频率差异。 结果:在全部IgA肾病患者和健康对照中,共发现37种HLA-DRB1等位基因,IgA肾病患者中有30种。其中HLA-DRB1*140101和HLA-DRB1*140501在患者组的基因频率较高,分别为10.43%和8.99%,与健康对照组(4.90%和2.45%)相比具有统计学意义(p=0.013,OR=2.263;p=0.001,OR=3.938)。而HLA-DRB1*070101、HLA-DRB1*080302和HLA-DRB1*160201在患者组的基因频率显著低于健康对照(p<0.001,OR=0.205;p=0.014,OR=0.412;p=0.031,OR=0.307)。在临床分组中,HLA-DRB1*150101在高血压组分布显著高于血压正常组(p=0.043,OR=2.218);HLA-DRB1*090102在血清IgA异常组分布显著低于血清IgA正常组(p=0.037,OR=0.289);HLA-DRB1*120101在无肉眼血尿组的分布频率显著低于有肉眼血尿组(P=0.021,OR=6.825);HLA-DRB1*030101和HLA—DRB1*040601在肾功能减退组的分布频率显著高于肾功能正常组(p<0.001,OR=5.645;p=0.015、OR=8.033)。 结论:HLA-DRB1*140101和HLA—DRB1*140501与中国南方汉族人群IgA肾病的发病显著相关,可能是IgA肾病发病的易感基因,而HLA-DRB1*070101、HLA-DRB1*080302和HLA-DRB1*160201则可能是IgA肾病的保护基因。HLA-DRB1的基因多态性与IgA肾病的临床表现、病理类型也存在一定的相关性,其中HLA-DRB1*150101可能是患者血压异常的易感基因,HLA-DRB1*120101可能是患者出现肉眼血尿的易感基因,HLA-DRB1*030101和HLA-DRB1*040601则可能是患者肾功能减退的易感基因,而HLA-DRB1*090102则可能是患者血清Igh正常的保护基因。   总结:   1.中国南方汉族人群HLAⅡ类基因多态性同IgA肾病的发生具有相关性。 2.中国南方汉族人群HLAⅡ类基因多态性与IgA肾病不同临床表现及病理变化之间也存在相关性。 3.发现了一个新的HLA-DPB1基因调控区SNPs位点,-64C/T。 4.在中国南方汉族人群中,HLA-DPB1基因调控区SNPs同IgA肾病可能不相关。
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