河南省部分地区犬腺病毒2型和犬细小病毒的流行病学研究

来源 :河南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ting1991
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犬腺病毒(Canine Adenovirus,CAV)和犬细小病毒(Canine Parvovirus,CPV)分别是导致犬腺病毒病和犬细小病毒病的重要病原。CAV是哺乳动物腺病毒属中致病性最强的病毒之一,根据分子生物学和血清学特性分为犬腺病毒Ⅰ型(CAV-1)和犬腺病毒Ⅱ型(CAV-2)两个血清型。其中CAV-1主要引起犬传染性肝炎和熊、狐脑炎,CAV-2主要引起犬科动物传染性喉气管炎和传染性腹泻。CPV属于细小病毒科细小病毒属,感染CPV的犬会引起严重出血性肠炎与急性休克的心肌炎,此外,CPV还可感染狐狸、狼、狗、猫、水貂及浣熊等动物。本文通过河南部分地区犬腺病毒和犬细小病毒等相关基因序列的生物学信息分析,对于今后河南部分地区犬腺病毒和犬细小病毒进一步研究及其疾病的防控具有一定的参考借鉴意义。试验一:犬腺病毒Ⅱ型流行病学调查及其五邻体基因生物学信息分析为进一步了解河南省部分地区犬腺病毒2型的流行情况。对2018-2020年河南部分地区(郑州市、开封市、洛阳市、许昌市、三门峡市、焦作市、安阳市)的犬只进行了分子流行病学调查,参照基于CAV E3区分型引物,CAV-2扩增片段大小为1031bp。对河南部分地区采集的粪便样本1410份进行CAV-2的PCR检测,并利用SPSS软件分析犬腺病毒病的感染率以及与感染犬的地区、年龄、品种、性别、季节和免疫情况之间的关系。结果表明,1410份粪便样品中有35份样品呈CAV-2阳性,阳性率为2.48%;CAV-2检出率与地区、品种和免疫情况相关(P<0.05),与年龄、季节和性别均无关。为了解河南部分地区腹泻犬中CAV-2五邻体基因的遗传变异情况,对CAV-2的阳性样本进行进一步的扩增分析,CAV-2五邻体基因的目的片段大小为1500bp。对其中的6株CAV-2五邻体基因进行序列比对和同源性分析,结果表明,测定出的病毒样品与标准毒株Toronto A26/61的基因序列同源性均可达到99%,说明6株分离株与国内外CAV-2型毒株无明显差异。试验二:犬细小病毒流行病学调查及其VP2基因序列分析为进一步了解河南省部分地区犬细小病毒的流行情况。对2020-2021年河南部分地区(郑州市、开封市、漯河市)的犬只进行了分子流行病学调查,以CPV VP2保守区设计引物,扩增片段大小为392bp。对河南部分地区采集的粪便样本448份进行CPV的PCR检测,并利用SPSS软件分析犬细小病毒病的感染率以及与感染犬的地区、年龄、品种、性别、季节和免疫情况之间的关系。结果表明448份粪便样品中有73份样品呈CPV阳性,阳性率为16.29%;CPV检出率与地区、年龄、品种、季节和免疫情况相关(P<0.05),与性别无关。为了解河南部分地区腹泻犬中CPV VP2基因遗传变异情况,对CPV的阳性样本进行进一步的扩增分析,CPV VP2基因目的片段大小为1755bp。对其中的9株CPV VP2基因全序列进行序列比对和同源性分析,结果表明,测定出的病毒样品与国内外CPV VP2基因序列同源性均可达到98%以上,对扩增出的VP2基因全序列的2个关键位点(第323位和426位)氨基酸分析,其中3株为CPV-2a型,6株为CPV-2c型,可推测目前河南部分地区常见CPV流行毒株为CPV-2a和CPV-2c型。试验三:犬细小病毒对犬肠道菌群的影响为明确河南部分地区CPV与犬肠道菌群的关系,基于16S r RNA基因进行种群、丰度及群落结构等多样性分析,结果表明CPV感染犬肠道菌群多样性显著高于健康犬(P<0.05)。在门分类水平上,CPV阳性的犬(P),其变形菌门Proteobacteria丰度组成显著高于健康犬(N)(P<0.05),厚壁菌门Firmicutes、放线菌门Actinobacteria丰度组成显著低于健康犬(P<0.05);科分类水平上,CPV阳性的犬(P),其普雷沃菌科Prevotellaceae、双歧杆菌科Bifidobacteriaceae、莫拉菌科Moraxellaceae、微柔菌科Veillonellaceae丰度组成显著低于健康犬(P<0.05);拟杆菌科Bacteroidaceae、肠杆菌科Enterobacteriaceae、肠链球菌科Peptostreptococcaceae丰度组成显著高于健康犬(N)(P<0.05)。样品复杂度的分析发现健康犬和CPV感染犬肠道微生态中菌属是有明显差异的,CPV感染犬和健康犬差异有统计学意义的肠道菌属有几十种,尤其表现为:普雷沃菌属Prevotella、乳酸菌属Lactobacillus、伊格纳茨氏菌属Ignatzschineria等在CPV感染犬中显著降低(P<0.05);志贺氏菌属Shigella、厌氧螺旋菌属Anaerobiospirillum、胃链球菌属Peptostreptococcus等在CPV感染犬中显著升高(P<0.05)。本试验对CPV感染对犬肠道菌群的影响进行研究,结果提示感染CPV会导致犬只肠道菌群结构特征发生明显的改变,为犬CPV感染与犬肠道菌群关系及其相互影响的研究提供了重要参考依据。
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