目前,因为我国公路货运行业大部分的承运人为个体司机,所以其上游托运人难以取得运费的增值税专用发票进行纳税抵扣,从而增加了托运人的应税负担。为此,国家出台了相关的网络货运管理办法和税务规定,对其按照交通运输服务进行增值税的征缴。这虽然解决了托运人难以取得运费发票进行纳税抵扣的问题,但是也将运营涉税风险由个体承运人转移给了网络货运平台。本文以山东省某网络货运公司实际运营发展数据分析为切入点,通过财务报表分析、访谈等方式发现问题,使用风险矩阵模型分析企业存在的风险点。通过多方调研发现该公司存在发票虚开、油气票虚假抵扣、企业所得税方面无发票列支成本、支付给司机的运费未按规定代扣代缴个税、货运合同未缴纳印花税等重大的涉税风险,而以上问题主要由增值税税负过高、难以取得合理发票税前抵扣、监管力度不足、企业内控失灵和行业恶性竞争等原因引发。为切实减少企业面临的风险,针对上述风险的成因,在企业微观和国家宏观政策方面提出了切实可行的建议。对于网络货运企业运营涉税风险管控的研究,可以发现经营活动中的问题和行业面临的困境,对此类企业把控风险合规经营和行业健康发展有重要意义,对促进我国物流行业转型升级也至关重要。运营风险的产生一方面是企业内控问题,另一方面也是由于部分国家税收政策等不科学、不完善引起的。这就要求企业要严格加强自身管理依法合规经营,政府监管层面要完善制度法规保障市场主体的合法利益,同时应通过行业扶持政策等支持行业发展。