目的：应用FreeSurfer软件基于脑表面形态学的分析方法，初步研究特发性全面性癫痫患者脑皮层形态学（全脑皮层厚度、表面面积、体积）的微观结构改变，探讨这种新技术对特发性全面性癫痫的应用价值，并分析异常脑区与临床变量（病程、发病起始年龄）的相关性。方法：收集2011年3月至2013年9月遵义医学院附属医院门诊及住院特发性全面性癫痫患者16例（经高年资神经内科及儿科医师按照2005年国际抗癫痫联盟诊断癫痫和癫痫综合征的标准进行筛选），男6例，女10例，同时招募16例健康志愿者作为对照组，两组性别、年龄、教育程度及利手相匹配。所有受试对象采用西门子公司3.0T Trio A Tim超导MR扫描仪进行常规序列和高分辨率3D-T1WI结构像。皮层厚度、表面面积及体积的分析采用FreeSurer软件，采用一般线性模型进行分析；年龄及性别作为协变量，设P<0.05为两组差异脑区有统计学意义。采用SPSS17.0软件分析异常脑区与临床变量（病程及发病起始年龄）的相关性。本实验得到遵义医学院伦理委员会的批准，受试者均被告知相应的权利和义务，并征得本人及家属同意并签署参与研究的知情同意书。结果：患者组与对照组性别、年龄、受教育程度均无统计学差异（P值分别为1.000、0.960、0.084）。与正常对照组相比，患者组脑形态学改变为：右颞中回皮层变薄（P=0.0109），左脑未见异常脑区。左颞中回表面积减小（P=0.0003）；左额下回中部（P=0.0002）、左外侧枕叶（P=0.0436）、右岛叶（P=0.0007）表面积增大；左颞上回（P=0.0119）体积减小，右大脑体积未见异常脑区。上述异常脑区与患者病程、发病起始年龄无相关性（P>0.05）。其中，皮层厚度异常脑区（右颞中回）与病程的相关分析P值（P=0.06）接近于0.05。结论：本研究发现IGE皮层厚度、表面面积及体积多个脑区异常，反映了IGE的微观结构形态学的变化，为IGE潜在的神经病理、解剖学的变化以及病理生理机制的理解提供影像学依据。