RPS6KA1在肺腺癌中表达水平及预后价值

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目的:核糖体蛋白S6激酶(RPS6KA1)是一个高度保守的Ser/Thr激酶,别名RSK1,属于RSK家族成员,近年来有较多研究报道RSK家族与多种肿瘤的发生和发展有关,但其在肺癌中所发挥的作用研究较少。本研究的主要目的是探讨RPS6KA1在肺腺癌中的表达水平和预后价值。方法:在本研究前期,首先对本院21例非小细胞肺癌(non-Small Cell Lung Cancer,NSCLC)患者组织标本进行RNA-seq测序得到RPS6KA1表达水平并进行全面分析,而后应用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)表达谱数据库RNA测序数据进行了验证,运用Kaplan-Meier生存分析,单因素与多因素COX回归分析用于评估RPS6KA1在肺腺癌中的预后价值,GO分析等功能分析方法用于分析该基因在肺腺癌的发生和进展过程中发挥的主要功能。应用免疫组织化学染色(Immunohistochemistry,IHC)方法检测RPAS6KA1在本院112例肺腺癌及60例癌旁肺组织中的蛋白表达水平,运用Kaplan-Meier生存分析,单因素与多因素COX回归分析评估RPS6KA1与肺腺癌患者预后的关系。应用TCGA数据库及CIBERSORT方法测算出RPS6KA1在肺腺癌中与22种免疫细胞浸润相关性。R语言、SPSS 23.0、Graph Pad Prism 8.0为本研究的主要分析及绘图工具。结果:TCGA表达谱数据库分析显示:肺腺癌(Lung Adenocarcinoma,LUAD)中RPS6KA1表达水平低于癌旁正常组织(P<0.001),低表达组的总生存期(Overall Survival,OS)和无进展生存期(Progression Free Survival,PFS)均低于高表达组,差异具有统计学意义(P=0.0010,P=0.0299)。对本院肺腺癌患者病理组织切片进行IHC分析,结果显示:RPS6KA1在肺腺癌组织中的表达水平低于癌旁肺组织中的表达水平(P<0.0001)。肺腺癌中RPS6KA1表达水平在不同病理分期中无显著差异(P=0.4631)。RPS6KA1低表达与肺腺癌患者预后不良相关(OS:P=0.0025,PFS:P=0.0285)。我们发现对病理分期分层分析表明在晚期肺腺癌患者中RPS6KA1预测不良预后效能更为精确。生存分析、单因素及多因素COX回归分析结果显示:RPS6KA1可以作为肺腺癌患者OS及PFS的独立的预后因素。GO基因功能分析显示:在肺腺癌中与RPS6KA1正相关的基因主要在IFN-γ介导的信号通路、T细胞共刺激、抗原处理和提呈等生物学过程中。通过对TCGA中肺腺癌患者的RNA-seq表达谱数据进行CIBERSORT方法测算出RPS6KA1与免疫细胞浸润相关性结果显示:在LUAD中,RPS6KA1与激活的CD4~+记忆性T细胞、浆细胞、肥大细胞、树突状细胞存在相关性。结论:以上的结果说明RPS6KA1在肺腺癌的发生发展过程中起着至关重要的作用作用,可以作为一种新的肺腺癌的独立预后因素并且有可能成为新的治疗靶点。
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