拟南芥假尿嘧啶合酶家族突变体鉴定及基因功能分析

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生物体RNA中存在多种转录后修饰,如:甲基腺苷、甲基胞嘧啶、肌苷和假尿嘧啶修饰等。其中假尿嘧啶修饰是目前已知丰度最高的RNA修饰,假尿嘧啶普遍存在于rRNA、tRNA、snRNA和snoRNA等非编码RNA中,近年来研究发现假尿嘧啶修饰也普遍存在于mRNA中。假尿嘧啶合酶催化RNA中尿嘧啶形成假尿嘧啶,所有的假尿嘧啶合酶都有一个保守的核心折叠区域与活性位点,假尿嘧啶合酶催化底物不需要任何辅助因子。关于假尿嘧啶修饰及假尿嘧啶合酶的功能研究,多见于大肠杆菌、酵母、人和哺乳动物中,在植物中的研究很少。为了研究植物中假尿嘧啶合酶的功能,我们订购了拟南芥假尿嘧啶合酶家族22个成员的46种T-DNA插入突变体,经鉴定后得到36种纯合突变体株系。为了研究它们的功能,我们利用4种不同胁迫来处理这些突变体,并对其表型进行了鉴定。研究结果表明:与正常条件下相比,在120 mMNaCl胁迫下,绝大多数突变体与野生型(WT)种子萌发时间会延迟1-2 d,但突变体与WT无显著差异;后期研究发现,基因AtCYG1(Cotyledons green,AtCYG1)可能响应盐胁迫,与WT相比,其2个突变体atcyg1-1和atcyg1-2在120mMNaCl处理下,子叶变绿率明显高于WT,但正常生长条件下2个突变体与WT无显著差异。在300 mM Mannitol胁迫下,突变体与WT种子萌发时间会延迟大约2d,但各种突变体与WT差异不显著。在0.05μMIAA条件下,各种突变体与WT种子萌发率无明显差异。在0.5 μM ABA处理下,这些植物种子萌发时间会推迟1 d左右,子叶出现时间较正常条件下晚,但各种突变体与WT无显著差异。研究表明,正常生长条件下,基因AtFCS1(Leaf curly and small,AtFCS1)缺失导致植株弱小,叶片小且卷曲,生长缓慢,结籽率低,生长周期显著长于WT。另外,该突变体atfcs1-1幼苗时期的Fv/Fm值低于WT,说明突变体的光合作用效率较WT低;该突变体的失水率快于WT,叶表面温度低于WT,突变体气孔关闭对ABA不敏感,这些结果说明该基因在拟南芥应答干旱胁迫中发挥重要作用。为进一步研究AtFCS1的功能,我们构建了该基因的回补、超表达融合GFP标签和GUS重组载体,并得到了各种转基因植物。在atfcs1-1突变体中重新表达AtFCS1基因后能恢复突变体的表型,说明突变体的表型确实是由AtFCS1缺失导致的;亚细胞定位分析显示AtFCS1定位于线粒体,且在保卫细胞中优势表达。以上实验结果为下一步研究AtFCS1基因的作用机制及假尿嘧啶合酶的功能奠定了基础。
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