芦花鸡是我国较为原始的肉蛋兼用型品种,有着独特的外貌特征:全身羽毛呈黑白相间、宽窄一致的斑纹状。芦花表型是家禽中首先发现的性连锁遗传表型,但关于它的形成机制目前还在进一步探索中。本研究以不同表型的芦花鸡和非芦花表型的地方鸡为研究对象,研究其与CDKN2A基因上的4个SNP位点的关系,建立芦花基因的分子检测技术,这将对我国芦花鸡的选育与芦花基因的应用有重要意义。本研究采用PCR扩增和DNA Sanger测序的方法,扩增了汶上芦花鸡、广西鸿光芦花鸡、白芦花文昌鸡、黑芦花文昌鸡和非芦花表型的文昌鸡以及粤黄鸡麻羽系的CDKN2A基因上含有的跟芦花表型关联的4个SNP位点的序列,并对其进行基因分型。分析发现汶上芦花鸡、广西鸿光芦花鸡、白芦花文昌鸡、黑芦花文昌鸡的芦花表型与CDKN2A基因上的SNP1、SNP2和SNP3这3个SNP位点存在关联。汶上芦花鸡的3个SNP突变均为纯合突变,黑芦花文昌鸡公鸡的3个SNP位点均为杂合突变。非芦花表型的文昌鸡和粤黄鸡麻羽系CDKN2A基因上的该3个SNP位点均未发生突变。此外,上述所有性连锁地方芦花鸡和非芦花表型的地方鸡在CDKN2A基因上的SNP4位点均未发生突变。利用线上软件SHEsis进行单倍型分析时,发现CDKN2A基因上的SNP1、SNP2和SNP3这3个SNP位点为强连锁关系,有2种SNP单倍型。一种是与我国性连锁地方芦花鸡表型相关联的GAA单倍型,另一种是与我国性连锁地方芦花鸡表型不关联的ACT单倍型。最后,本研究成功建立了能准确、快速检测性连锁芦花鸡表型及其基因型的分子方法。综上所述,本文验证了我国性连锁地方芦花鸡表型与CDKN2A基因上的SNP位点的关系,发现我国性连锁地方芦花鸡表型与CDKN2A基因上的SNP1、SNP2和SNP33个SNP位点相关联,与SNP4位点不关联,且SNP1、SNP2和SNP3这3个SNP位点相互连锁。据此,建立了快速检测性连锁芦花基因的分子检测技术。