乳酸在食品、医药、化妆品、农业、化工等方面都有着广泛的应用,是生物体机体代谢的重要中间产物,也是世界上公认的三大有机酸之一。然而,目前报道的能够产乳酸的芽孢杆菌菌种很少。本文从内蒙古传统发酵酸奶中分离出一株菌种DU-106,该菌具有高产乳酸的特性。本论文进一步对该菌株进行系统分类地位鉴定并进行比较基因组学分析,本文结果与结论如下:菌株DU-106为革兰氏阳性菌,呈现棒状,增殖方式为内生孢子,兼性厌氧型,能够高效产生乳酸,发酵72 h之后L-乳酸的产量达到13.04g/L。基于16S r RNA基因序列的系统发育分析得到该菌株DU-106隶属于蜡状芽孢杆菌菌群。通过测序并绘制菌株DU-106的基因组完成图,结果表明:它具有环状染色体和三种质粒,总基因组大小为5,758,208 bp,G+C含量为35.10%。分析核心基因组单核苷酸多态性并与已知的蜡状芽孢杆菌菌种作对比,除了蜡状芽孢杆菌ATCC 14579T和苏云金芽孢杆菌ATCC 10792T之外,菌株DU-106与其他蜡状芽孢杆菌菌种的平均核苷酸均一性值均<92%。运用DNA-DNA杂交分析显示菌株DU-106与参考菌株蜡状芽孢杆菌ATCC14579T和苏云金芽孢杆菌ATCC 10792T的DNA-DNA杂交值分别为35.40%和14.43%,这说明DU-106均不属于现已知的蜡状芽孢杆菌菌种。与蜡状芽孢杆菌ATCC 14579T和苏云金芽孢杆菌ATCC 10792T相比,菌株DU-106含有更高含量的iso-C15:0脂肪酸。综合基因组特性分析与DNA-DNA杂交值和生理学和生物化学特性分析,可以得出菌株DU-106是蜡状芽孢杆菌菌群中的一株新菌种,并命名为乳酸芽孢杆菌（Bacillus lactis）。并于广东省微生物保藏中心保藏,保藏编号:GDMCC 1.1581.通过耐酸、耐盐和模拟胃肠道液试验发现该菌株在低酸、高盐和模拟胃肠液环境中都能保持良好的存活率,其中在p H为2.42和4.94中的存活率分别为72.09%和96.77%,在0.3%的胆盐、模拟胃液和模拟肠液中的存活率分别为59.67%,74.29%和150.52%。进一步通过比较基因组学分析挖掘发现:该菌株中注释了各种与应激相关的胆汁盐抗性和粘附相关的基因,比如bass,cgh,cbp,fbp III,这可能通过使宿主上皮细胞粘附和胃肠道存活而发挥益生作用。此外,菌株DU-106基因组缺乏毒力基因编码脑苷合成酶、肠毒素FM和细胞毒素K。通过急性经口毒性试验进一步证实该菌株没有毒性。综合该菌株的表型特征、基因组特性和益生特性,可以为该菌株DU-106成为益生菌应用开发提供充足的理论依据。