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目的：探讨新疆地区汉族、维吾尔族人群CD36基因多态性与急性冠脉综合征(ACS)发病的关联性。方法：采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,对522例ACS患者和1215例健康对照组CD36基因2个单核苷酸多态性(SNP)位点进行基因型鉴定。结果：入选本研究的两个民族人群的年龄、性别在急性冠脉综合征组与对照组之间差异不显著,无统计学意义(P>0.05),具有良好的组间可比性。在汉族和维吾尔族人群中,ACS组和对照组rs1722505位点的基因型及等位基因分布差异显著,均具有统计学意义(P值均小于0.05)。在汉族人群中ACS组中rs17154181的A等位基因频率明显低于对照组(P=0.034)。但在维吾尔族人群中rs17154181位点,三种基因型及等位基因频率分布在ACS组及对照组间分布差异不显著,无统计学意义。多因素非条件Logistic回归分析显示,调整混杂因素后,在汉族和维族人群中rs1722505的AA+AG基因型者患ACS的风险明显高于GG基因型者,汉族(OR=1.436,95%CI=1.047-1.97, P=0.025),维族(OR=1.589,95%CI=1.009-2.473,P=0.046)。汉族人群rs17154181的AA+AG基因型者患ACS的风险明显低于GG基因型者(OR=0.667,95%CI=0.494-0.9,P=0.008)。结论：CD36基因rs1722505位点,在汉族和维吾尔族人群中,急性冠脉综合征组和对照组的基因型分布及等位基因频率差异具有统计学意义。对于rs17154181位点,汉族人群中急性冠脉综合征组中等位基因及基因型频率分布在两组间均有统计学意义,而在维吾尔族人群中则无统计学意义。CD36基因可能与新疆地区汉族及维吾尔族人ACS的发生相关,rs1722505的AA+AG基因型可能是汉族及维族人ACS的危险因素,rs18154181的AA+AG基因型可能是汉族人群ACS的保护因素。