生存数据中基于加速失效时间模型的亚组识别策略

来源 :南方医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qqwc112
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
背景亚组识别是精准医学的重要手段,生存数据是临床试验中极为常见的资料类型,如何对这类数据中潜在的获益亚组进行可靠的甄别是亟待解决的问题。对于该类数据的亚组识别,常用的Cox 比例风险模型的前提假设有时是不成立的,而加速失效时间(Accelerated Failure Time,AFT)模型不需要满足该假定,可以作为替代模型。在生存分析中,常规的模型通常适合于协变量少而样本量多的数据。而对于协变量数量超过样本量的数据,常规模型不再适用,需考虑惩罚模型。因此,本研究探索了单变量AFT模型和引入Adaptive Elastic Net的惩罚AFT模型在生存数据中亚组识别的能力。目的针对临床试验中的右删失生存数据,基于AFT模型提出一种新的亚组识别策略。方法在单变量AFT模型以及引入Adaptive Elastic Net的AFT模型(惩罚模型)中,通过检验协变量与治疗组别的交互项来识别亚组相关协变量;并在单变量模型中通过Benjamini-Hochberg法来控制错误发现率。基于所筛选的亚组相关协变量计算患者的预测得分。基于change-point算法建立分类器寻找预测得分的截断点以对患者进行亚组划分。采用适应性设计对所识别的获益亚组的治疗效果进行评价。通过模拟研究,(1)对比含/不含协变量主效应的单变量模型,结合不同分类器在不同样本量、删失比例、亚组比例下的亚组识别效果。(2)对比含/不含协变量主效应的单变量模型和惩罚模型,结合change-point算法在样本量不超过协变量个数(n≤p)、样本量远大于协变量个数(n>p)数据中,不同情形下的亚组识别效果。结果模拟结果显示,(1)不同情形下,不含协变量主效应的单变量模型优于含主效应的单变量模型;亚组比例小于0.5时,基于change-point算法的分类器优于基于中位数的分类器。(2)含协变量主效应的惩罚模型优于不含主效应的惩罚模型;在样本量较小、删失率较高以及样本量不超过协变量个数(n≤p)的情况下,含协变量主效应的惩罚模型在获益亚组的识别上有明显的优势;而其他情况下,则是不含主效应的单变量模型较优。在二阶段适应性设计中,含协变量主效应的惩罚模型、不含主效应的单变量模型的Ⅰ类错误都能控制在0.05左右。当潜在获益亚组时,相比于传统设计,适应性设计很大程度上提高了检验效能。结论不含协变量主效应的单变量AFT模型、含协变量主效应的惩罚AFT模型适用于生存数据的亚组识别。在样本量不大、删失率不低以及n≤p的情况下,后者占优;而其他情况下则是前者占优。相比于传统设计,二阶段适应性设计更适用于潜在获益亚组的疗效评价。
其他文献
目的:本研究的目的是应用二维斑点追踪技术(two-dimensional speckle tracking imaging,2D-STI)评价左室射血分数≥55%的慢性肾脏病(chronic kidney disease,CKD)患者左室应
随着现代科技的不断进步,DNA技术越来越受到重视。作为能够识别锁定嫌疑人的有力工具,DNA检验技术在刑事案件检验中得到广泛应用在重大疑难案件中发挥了重要作用。陈旧生物样
本研究以栽培型梁山慈竹(ZPX)以及经体细胞突变获得的稳定的不同基因型梁山慈竹新品系为材料,对其生物学特性、生物量、竹笋解剖结构、茎秆化学成分、竹材造纸性能、原纤维性能
卵巢癌是一种常见的妇科恶性肿瘤,同时也是最致命的女性疾病之一。由于潜在症状不明显,且缺乏可靠的早期筛查方法,约70%卵巢癌患者被诊断时已为晚期。不同阶段的卵巢癌患者生
目前,随着显像设备和放射性药物的发展,放射性核素显像在医学影像技术中的地位越来越重要。单光子发射计算机断层显像和正电子发射断层成像术是核医学的两种CT技术,由于它们
随着宽带网络的不断发展,在线数字娱乐领域近年来发展非常迅速,在线数字娱乐系统变得越来越复杂。如何在不断增加新功能的基础上保持软件系统的健壮性,成了在线数字娱乐系统
目的:比较改良后腹腔镜下解剖性肾上腺切除术(modified anatomical retroperitoneoscopic adrenalectomy,MARA)与传统解剖性后腹腔镜肾上腺切除术(anatomical retroperitoneo
海蓬子是一种营养丰富的盐生植物,既可以作为一种时令蔬菜,也可被当做草药食用,具有治疗便秘、减肥、防癌、抗炎等功能。由于海蓬子发芽率低,生长周期长等原因在一定程度上限
乳腺癌是女性最常见的自发性恶性肿瘤疾病,严重威胁了女性的健康。饮食是乳腺癌的一大危险因素,但是饮食中的游离态胆固醇、脂肪酸与乳腺癌之间的关系依然不明确。以往的相关
从1830年至1960年,法国对西非大陆的殖民长达一个多世纪。尽管1960年后,大部分非洲国家通过反殖民斗争获得了国家民族独立,法国的殖民体系也已土崩瓦解,但殖民记忆对法国和被