[目 的]肺部感染是世界上主要的疾病负担之一,病原体检测是指导肺部感染性疾病抗生素使用的关键。分析宏基因组二代测序技术（Metagenomic Next-generation Sequencing,mNGS）对肺部感染性疾病病原体的检测能力,探讨mNGS在肺部感染诊断中的临床价值及对患者后续治疗影响。[方 法]回顾性分析,以2020年12月至2021年12月昆明医科大学第一附属医院呼吸科疑诊肺部感染的127例住院患者为研究对象。收集研究对象的基本信息（性别、年龄）、基本临床资料（基础病、行mNGS检测前抗生素使用时间、出院诊断）、实验室数据及影像学表现（mNGS检测报告、培养、涂片、呼吸道九项、肺炎及呼吸道相关病原体基因检测、病理报告及胸部CT）。所有患者入院后均行电子支气管镜检查并留取支气管肺泡灌洗液（Bronchoalveolar Lavage Fluid,BALF）送检mNGS,同时对患者行常规检验（培养、涂片、血清学特异性抗体检测、恒温芯片扩增检测DNA）,比较mNGS与常规检验对病原体检出率的差异,比较两种检验方法对阳性病例检出结果的一致性,比较两种检验方法对混合感染检出率的差异性。根据mNGS结果有无调整抗生素治疗分为3组:调整治疗方案组、维持原治疗方案组（原抗生素已覆盖部分病原体）及经验性抗感染治疗组,比较3组间患者疾病治疗有效率的差异性,探讨mNGS在肺部感染性疾病病原体检测及指导治疗中的价值。使用SPSS 25.0统计软件,两种检验方法检测情况比较用配对卡方检验,组间比较用秩和检验。[结 果]1.比较mNGS与常规检验病原体检出率的差异:本研究中,127名患者留取BALF行mNGS,同时送检常规检验,其中mNGS检出病原体98例,阴性29例,阳性率77.2%,常规检验检出病原体51例,阴性76例,阳性率40.2%,两者检出率差异具有统计学意义（P＜0.001）。mNGS共检出45种病原体,其中25种细菌（最常见为肺炎链球菌33株、脓肿分枝杆菌24株、流感嗜血杆菌12株、肺炎克雷伯菌8株、结核分枝杆菌8株）;8种真菌（常见为耶氏肺孢子菌12株、烟曲霉5株、新生隐球菌4株、白色假丝酵母菌2株、土霉菌2株）;10种病毒（常见为EB病毒15株、巨细胞病毒11株、人疱疹病毒7型13株、人偏肺病毒1株）;4种非典型病原体（肺炎支原体6株、鹦鹉热衣原体4株、解脲衣原体1株、嗜肺军团菌1株）。常规检验共检测出18种病原体,其中细菌12种（常见为肺炎克雷伯菌9株、抗酸杆菌9株、铜绿假单胞菌4株、流感嗜血杆菌4株）;真菌4种（白色假丝酵母菌5株、近平滑假丝酵母菌3株、黄曲霉1株、毛霉菌1株）;病毒1种（EB病毒2株）;非典型病原体1种（肺炎支原体10株）。两种检验方法在细菌、真菌、病毒3类病原体检出率之间均存在差异（P＜0.05）,mNGS检出率更高,但在非典型病原体检出率之间无明显差异（P＞0.05）。2.比较mNGS与常规检验混合感染检出率的差异:与常规检验相比,mNGS在混合感染检测方面更具优势,mNGS检测出60例混合感染,常规检验检测出4例混合感染,两者检出率差异具有统计学意义（P＜0.001）。混合感染类型中,最常见的感染类型是细菌-病毒、其次是细菌-真菌和细菌-细菌。3.比较患者疾病治疗有效率的差异:根据mNGS结果调整治疗方案组、维持原治疗方案组及经验性抗感染治疗组患者的疾病治疗有效率,经两两比较发现:调整治疗方案组与维持原治疗方案组组间有效率无统计学差异（P＞0.05）,调整治疗方案组与经验性抗感染治疗组组间有效率有统计学差异（P＜0.05）,根据mNGS结果调整抗生素治疗后取得更好治疗有效率;维持原治疗方案组与经验性抗感染治疗组组间有效率有统计学差异（P＜0.05）,维持原方案组取得更好治疗有效率。因此,在mNGS结果指导下应用抗生素治疗肺部感染性疾病可取得更好的临床效果。4.耐药菌株的检出:127例患者中,mNGS在2份BALF样本中检测出耐药菌株,其中1株为肺炎链球菌,另外1株为金黄色葡萄球菌,耐药基因均为ErmB基因。常规检验在6份痰样本检测到耐药菌株,其中2例在mNGS检测中检测到相同菌株,但未检测到耐药基因。[结 论]1.与常规检验相比,mNGS对病原体的检出率更高,尤其在检出细菌、真菌及病毒方面。2.mNGS有助于检出混合病原体感染,最常见的混合感染类型是细菌-病毒混合,其次是细菌-真菌及细菌-细菌混合感染。3.根据mNGS结果指导抗生素治疗肺部感染性疾病,可以取得更好的临床疗效。4.mNGS可检测耐药基因,但对耐药菌株及耐药基因的检测能力仍需进一步探索。