2003年非典事件拉开了我国行政问责风暴的序幕,行政问责制不仅成为学术界关注的热点,而且也是当前我们政府工作的重中之重。行政问责制的有效运行对我国的政治体制改革和法治社会的建设具有重要的现实意义,对建设责任政府有着至关重要的作用。随着理论探讨的逐步细致和深化,行政问责制日臻成熟,逐步走向规范化、程序化。但是,在运行过程中仍出现了一些困境,亟需我们进一步完善和创新。作为现代民主行政的重要内容,行政问责制度是一种旨在全面追究和实现政府责任的监督机制。而行政问责制运行困境则是我们当前需要着重研究的问题。从行政问责要素的角度来说,这些要素均存在不足。例如,异体问责薄弱,客体界定混乱、问责程序断裂、缺乏完整的问责程序、救济体系缺失、问责结果异化。然而,这些要素的困境并非偶然,而是有其内在原因。为了使行政问责制逐步走上正轨,就要对这些困境予以解决,为优化今后的行政问责提供运行路径。因此,对行政问责制的优化成为政府工作的当务之急。本文着眼于行政问责制运行困境的分析,对其深层原因进行进一步的挖掘,与此同时,多措并举去完善我国行政问责运行机制。更新理念,统一认识,适应多变的社会环境;健全法律体系、规范问责程序,搞好行政问责制的配套制度建设,提供坚实的法律支持和依据;创新治理问责新技术。切实搭建完善行政问责的具体对策,为进一步研究行政问责制的发展方向提供了一定的参考。