2013年1月16日,全国中小企业股份转让系统有限责任公司正式揭牌运营。自此,非上市公司股份转让的小范围、区域性试点将开始渐次走向面向全国的正式运行,“新三板”由此产生。同年12月14日,国务院发布的《关于全国中小企业股份转让系统有关问题的决定》为股份转让系统业务规则提供了法律依据,建立并完善了“新三板”业务规则,“新三板”挂牌公司由此应运而生。“新三板”挂牌后能够为挂牌公司解决融资困难等问题,对我国资本市场的“倒金字塔”现象的改观起到推动作用。但是,相对于主板、中小板和创业板而言,“新三板”挂牌条件可以称为“无指标性挂牌条件”,准入门槛低,挂牌的企业多为中小企业,各项制度不够健全,企业在拟挂牌及挂牌阶段存在与“新三板”业务规则要求不够完全匹配的问题,这将导致其在未来运营过程中面临各种风险。鉴于目前围绕促进中小企业发展的相关税制改革或税收促进政策对其影响愈发显著,且涉税业务日益复杂,这一方面在“新三板”挂牌后能够为挂牌公司融资困难等问题的解决扫清一定障碍,另一方面由于税收法规体系的复杂性日趋增强,面临税务环境的不断变化,该类企业涉税风险会一定程度大幅提升。为此,识别“新三板”挂牌公司涉税风险,立足“新三板”挂牌公司税务风险内控机制展开研究,加强其涉税风险管理有着积极的现实意义。本文以“新三板”挂牌公司为主体,通过识别税务风险,明确各项风险的所属类型及成因,结合企业自身内控机制问题,从管理理念、组织结构、涉税事权、部门合作等方面,提出完善“新三板”挂牌公司税务风险内控机制的建议,形成有效的内控机制,达到降低税务风险、减少企业损失,提高企业整体效益的目的。