为了解决我国现阶段发展的人才供需矛盾,从21世纪初起,内地各大高校开始试行书院模式的探索,经历了近二十年的建设,书院制已经在“双一流”高校中有效推行。我国高校的书院制是在借鉴西方住宿学院制的基础上,融合传统中国书院育人精神的一种新型的高校学生治理模式,为学生营造有特色的社区文化氛围,强化住宿区对学生的育人功能,以达到个性化的全育人培养目标。但在实际运行中,书院治理遇到了许多问题,作为目标群体的学生对书院的评价褒贬不一。因此,研究“双一流”高校的书院治理有助于检验现有运行过程中的效果,及时发现存在的问题,为未来书院治理的发展提供建议和对策。本文以E大学为例,通过实证研究,以权变理论和综合激励模型为分析框架,剖析书院制在学生治理过程中的经验与成效,分析存在的问题及其内在原因,从而提出完善“双一流”高校书院治理的政策建议。本文采用个案研究法、问卷调查法、访谈法相结合的研究方法,对E大学书院治理的目标和成效进行了分析。E大学通过对复杂治理情境的分析,运用多样化的治理手段、层级性的治理资源,在各书院建立了拥有较完善公共服务设施和服务功能的学生社区,书院内部建立了相对完善的组织架构,并且能根据自身特色进行治理规划并设计丰富的活动,为学生创造利于个性化发展的空间。但在书院制实施过程中,仍存在着不少问题和矛盾,主要表现在:治理主体的横向和纵向协同不足、治理资源无法有效承载治理目标、治理手段无法满足目标群体的实际需求、目标群体参与治理的渠道有待拓展、对目标群体的正向激励不足等方面。通过对书院治理主体和目标群体展开调查,可以发现问题产生的原因有很多层面:治理理念和制度设计的缺失、治理过程中需求的多样化、对传统治理手段存在依赖性、治理过程中共识性的目标和导向存在分歧、治理成效的科学性考核缺位等。基于以上原因分析,本文认为书院治理是涉及多元治理主体、治理手段、治理层级的综合性治理,需要从以下几方面进行改进:精准对接目标群体需求,确立书院理念;完善书院治理结构,加强多方协同治理;强化书院治理手段,提升书院治理综合成效;完善目标群体激励机制,激发主动性;健全评价反馈机制,推动书院治理优化发展。