肿瘤组织及血浆KRAS突变与结直肠癌患者预后的相关性研究

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随着新型抗肿瘤药物的不断出现,晚期结直肠癌治疗的有效率及患者的总生存时间不断提高,特别是靶向药物EGFR(Epidermal growth factor receptor,表皮生长因子受体)单抗的应用,联合化疗可以使患者的生存期延长到两年,而且研究已经发现了EGFR单抗的疗效预测因子,即KRAS基因突变。在用药前,通过检测患者肿瘤组织的KRAS基因是否发生突变,来筛选敏感人群,初步达到了个体化应用。但是在个体化应用过程中,也存在一些很大的缺陷,由于肿瘤组织取材比较困难,而且不具备实时性,因此,找到能够满足实时性、方便可取,含有肿瘤组织遗传信息的替代物来代替肿瘤组织进行基因检测,就成了目前亟待解决的一个问题。随着检测技术的发展,KRAS基因突变的检测方法也面临着改革,有研究提出,目前公认的测序方法,灵敏度较低,可能会导致假阴性结果的出现,应该用灵敏度高的方法来检测。我们考虑灵敏度不同的两种方法检测,肯定会存在一类患者,即灵敏度低的方法检测为野生型,但灵敏度高的方法可能检测为突变型,也就是说这部分患者突变的量可能比较低。对于这部分患者,是否适合应用EGFR单抗,除了KRAS是否发生突变之外,KRAS突变的量(突变丰度)是否会对EGFR单抗的疗效及患者的预后产生影响?这在目前还没有任何相关的研究。KRAS突变虽然是EGFR单抗的疗效预测因子,但与单纯化疗患者预后的相关性目前仍然存在分歧,存在分歧的原因复杂,我们认为其中较为重要的一点,可能是因为各种研究采用的检测方法没有统一,检测方法的灵敏度高低不同。因此,为了探讨检测方法的不同对KRAS突变与单纯化疗患者预后相关性的影响;KRAS突变丰度对单纯化疗的患者疗效和预后的关系;以及血浆替代肿瘤组织进行KRAS基因突变检测的可行性,我们开展了此项研究。从2008年1月到2011年6月筛选接受过至少两个方案的单纯化疗(奥沙利铂为主或者伊立替康为主的方案)的晚期结直肠癌患者117例,根据RECIST(Response Evaluation Criteria in Solid Tumors,实体瘤疗效评价标准)评价标准,一线化疗有37例患者获得部分缓解(Partial response,PR)(31.6%),全体患者的中位PFS(Progression free survival,无进展生存时间)是6.3个月,中位OS(Overall survival,总生存时间)是19.5个月。用直接测序法和PNA-PCR(Peptide NucleicAcid-mediated PCR Clamping,肽核酸钳制PCR)方法分别检测了患者的肿瘤组织和配对血清中的KRAS突变状态,直接测序法检测肿瘤组织KRAS突变的患者46例,检出率为39.3%,血浆中KRAS突变的患者18例,检出率15.4%,与肿瘤组织的一致率为32.6%,野生与突变整体的一致率为70.9%,一致性较差(Kappa0.318,p<0.001)。用PNA-PCR方法检测肿瘤组织和血浆的KRAS基因突变,肿瘤组织KRAS突变的患者56例,检出率为47.9%,血浆中KRAS突变的患者35例,检出率为29.9%,与肿瘤组织的一致率为55.4%,野生与突变整体的一致性率为75.2%,一致性一般(Kappa0.496,p<0.001)。肿瘤组织的KRAS突变用直接测序法检测,而血浆用PNA-PCR方法检测,发现血浆与肿瘤组织的KRAS突变的一致率为63.0%,整体一致率为80.3%,一致性较好(Kappa0.570,p<0.001)。从以上结果我们可以看出,因为血浆游离DNA中含有的肿瘤组织特异性DNA量很低,因此更适合用灵敏度高的检测方法进行KRAS基因突变的检测,提高与肿瘤组织KRAS突变的一致率。将肿瘤组织的KRAS突变状态与单纯化疗的疗效进行统计分析发现,无论用直接测序法或者PNA-PCR方法,野生型与突变型的患者在ORR(Over responserate,总有效率)及PFS均没有统计学差异。在患者的预后方面,直接测序法检测的野生型与突变型患者在OS上的差异接近统计学意义(p=0.052),PNA-PCR方法检测的野生型与突变型患者的OS具有明显的统计学差异(p=0.010)。根据直接测序法和PNA-PCR方法的KRAS检测结果(KRAS突变丰度)将患者分为野生型组(两种方法检测的KRAS均为野生型)、高突变组(两种方法检测的KRAS均为突变型)和低突变组(直接测序法检测的为野生型,而PNA-PCR方法为突变型),三组患者在ORR及PFS上仍然没有差异,但野生型组患者的中位OS可长达21.3个月,低突变组的17.1个月,而高突变组的15.6个月,差异具有明显的统计学意义(p=0.033)。将这三组进行两两比较,结果显示,野生型组与高突变组OS的差异具有显著的统计学意义(p=0.029),与低突变组OS的差异接近统计学意义(p=0.058)。而高突变组和低突变组间的OS没有统计学差异。由此我们可以看出,低突变组的OS接近高突变组,野生型组的OS还是最长的。直接测序法或PNA-PCR方法检测的血浆中KRAS突变状态对单纯化疗的疗效没有影响,但与患者的OS具有明显的相关性。直接测序法检测的野生型患者比突变型患者中位OS长5个月,有统计学差异(p=0.009)。同样的,用PNA-PCR方法检测的野生型和突变型患者的OS分别是21.3个月和15.1个月,差异也具有明显的统计学意义(p=0.001),以上结果说明血浆中的KRAS基因突变状态与患者的OS存在相关性,KRAS突变的患者预后很差。血浆中KRAS突变可以作为单纯化疗患者预后的预测因子。以上结果表明,用PNA-PCR方法检测血浆中的KRAS突变与肿瘤组织的一致性较高,在肿瘤组织获取困难时,可以考虑通过检测血浆中KRAS基因的突变来指导个体化用药。不论何种方法检测KRAS基因突变,KRAS突变与单纯化疗的疗效没有相关性,不能作为疗效的预测因子。但是对于KRAS突变与单纯化疗患者预后的相关性,不同检测方法导致了不同的结论,从而证实目前研究中KRAS突变与单纯化疗患者的预后存在分歧的原因之一,可能就是检测方法的不同导致的。在本研究中,用直接测序法检测的野生型和突变型患者的OS没有统计学差异,而PNA-PCR方法检测的野生型和突变型患者的OS有明显的差异,因此,灵敏度高的PNA-PCR方法可能比直接测序法更适合肿瘤组织KRAS突变的检测。通过分析野生型组、高突变组和低突变组的OS发现,野生型患者的OS最长,低突变组的次之,高突变组的最短。因此如果按照KRAS基因突变的丰度进行更详细的分组,可能对预测患者的预后具有更重要的意义。这提示我们应该联合两种方法进行KRAS基因突变的检测,野生型患者最好用PNA-PCR方法来确定,从而能够降低假阴性结果的出现,而突变型患者则用传统的方法--直接测序法来确定,避免灵敏度高的方法,如PNA-PCR方法对KRAS微量突变的夸大,更好的预测患者的预后。而对于血浆中的KRAS突变,不论用哪种方法,KRAS突变都与患者的疗效没有相关性,但与患者的预后却存在明显的相关性,说明血浆中的KRAS突变是患者预后的预测因子。结论:不同的检测方法对KRAS突变预测单纯化疗患者的预后带来不同的结论,可能是导致目前KRAS突变与患者预后存在分歧的重要原因之一。灵敏度高的PNA-PCR方法联合传统的直接测序法进行KRAS突变的检测,将患者按照KRAS突变丰度进行分组,可能会对患者的预后具有更大的帮助。血浆中KRAS突变的检测推荐使用灵敏性高的方法,突变的患者预后较差。当患者的肿瘤组织获取困难时,血浆也可以考虑作为肿瘤组织的替代物进行KRAS基因突变的检测。
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