LINC02535与ADAR2相互作用共同调控p53信号通路对胃癌发生发展的影响

来源 :苏州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:bohedan
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
胃癌作为一种恶性肿瘤,已经成为严重威胁人们身体健康的重要因素。由于胃癌早期没有明显标志物,导致绝大部分患者确诊时已经到了中晚期,虽然诊断和治疗手段不断更新,但是胃癌患者的生存率仍然较低。因此,寻找更为有效的标志物,分析胃癌发生的具体机制,对胃癌的诊断和治疗有着积极作用。LncRNA是一种长度超过200nt的非编码RNA,主要在细胞核和细胞质中表达。LncRNA在肿瘤的发生和发展过程中有着非常重要的作用,LncRNA可以与mRNA、DNA和蛋白质相互作用,参与各种转录和翻译的过程,进而影响肿瘤细胞的增殖、迁移、侵袭和耐药等多方面的功能。目前的研究发现,LINC02535作为LncRNA的一种,能够通过调控相关基因以及信号通路,进而影响宫颈癌细胞的增殖、迁移和侵袭。但是,LINC02535是否在胃癌的形成中发挥作用尚未明确。本研究通过全转录组测序发现,LINC02535在病人胃癌组织中高表达,且差异极显著。并且通过体内和体外实验研究发现,LINC02535能够促进胃癌细胞的增殖、迁移、侵袭以及抑制胃癌细胞的凋亡。另外,分子机制研究发现,LINC02535与ADAR2相互作用,共同调控p53信号通路,影响胃癌的发生发展。第一部分胃癌样本全转录组测序分析及LINC02535在胃癌细胞中的功能研究目的:胃癌样本全转录组测序分析以及体内和体外研究LINC02535对胃癌细胞增殖、迁移、侵袭和凋亡的影响。方法:通过采集胃癌组织和对应癌旁正常组织样本进行全转录组测序。利用荧光定量 PCR 检测 LINC02535在人胃癌细胞系(SGC7901、MGC-803、HGC-27 和 BGC823)和正常胃粘膜上皮细胞系(GES-1)中的表达水平。构建干扰LINC02535以及过表达LINC02535的质粒。通过在高表达LINC02535的细胞系SGC7901和MGC803中转染干扰LINC02535质粒,下调LINC02535的表达,以及在低表达LINC02535的细胞系HGC27和BGC823中转染过表达LINC02535质粒,上调LINC02535的表达后,采用CCK-8实验以及克隆形成实验检测胃癌细胞的增殖能力,划痕实验测定胃癌细胞的迁移能力,Transwell实验检测胃癌细胞的侵袭能力,流式检测胃癌细胞的凋亡,WB实验检测迁移和凋亡相关蛋白的表达,阐述LINC02535对胃癌细胞迁移和凋亡的具体机制。另外,通过在BALB/c-nu雄性裸鼠皮下注射si-LINC02535和对照NC的SGC7901稳转细胞株,然后观察肿瘤的生长速度以及肿瘤中相关蛋白的表达,进一步探索LINC02535在体内和体外对胃癌发生发展影响。结果:全转录组测序结果显示,499个表达差异显著基因表达上调,627个差异基因表达下调。GO和KEGG通路分析发现这些差异表达基因主要参与细胞周期、cAMP信号通路、p53信号通路和同源重组等相关信号通路。与正常胃粘膜上皮细胞系(GES-1)相比,人胃癌细胞系(SGC7901、MGC803,HGC27和BGC823)中LINC02535的表达显著上调。细胞功能研究结果显示,与对照相比,干扰LINC02535的胃癌细胞系SGC7901和MGC803细胞增殖、迁移和侵袭能力有显著的下降,细胞凋亡率升高,迁移和凋亡相关蛋白的表达也相应的升高或降低;与之相反,过表达LINC02535胃癌细胞系HGC-27和BGC823细胞增殖、迁移和侵袭能力有显著的升高,细胞凋亡率下降,迁移和凋亡相关蛋白的表达也相应的升高或降低。体内实验发现,与对照NC的SGC7901稳转细胞株相比,si-LINC02535细胞株注射裸鼠皮下,肿瘤体积和重量都显著下降。结论:LINC02535在胃癌组织中的高表达,通过促进胃癌细胞的增殖、迁移、侵袭以及抑制胃癌细胞的凋亡影响胃癌的发生发展。第二部分LINC02535与ADAR2相互作用及ADAR2在胃癌细胞中的功能研究目的:探究LINC02535与ADAR2相互作用机制以及ADAR2对胃癌的影响。方法:通过RIP实验验证LINC02535与ADAR2的相互结合。利用荧光定量PCR检测ADAR2在人胃癌细胞系SGC7901,BGC823,MGC803,HGC27和正常胃粘膜上皮细胞系GES-1中的表达水平。构建过表达ADAR2质粒。通过在低表达ADAR2细胞系HGC27和MGC803中转染过表达ADAR2质粒,采用CCK-8实验以及克隆形成实验检测胃癌细胞的增殖能力;划痕实验测定胃癌细胞的迁移能力;Transwell实验检测胃癌细胞的侵袭能力;流式检测胃癌细胞的凋亡;WB实验检测与迁移和凋亡相关蛋白的表达阐述ADAR2对胃癌细胞迁移和凋亡的具体机制。在体内实验中,通过在BALB/c-nu雄性裸鼠皮下注射ADAR2过表达和对照NC的MGC803稳转细胞株,然后观察肿瘤的生长速度以及肿瘤中相关蛋白的表达进一步探索ADAR2对胃癌细胞影响。结果:与正常胃粘膜上皮细胞系(GES-1)相比,人胃癌细胞系(SGC7901,BGC823,MGC803和HGC27)中ADAR2的表达下调。体外的结果显示,与对照相比,过表达ADAR2胃癌HGC27和MGC803细胞系增殖、迁移和侵袭能力有显著的下降,细胞凋亡率升高,凋亡相关蛋白表达升高,迁移相关蛋白表达降低。体内实验发现,与对照NC的MGC803稳转细胞株相比,ADAR2过表达细胞株注射裸鼠皮下后,肿瘤的体积和重量都显著下降。结论:LINC02535与ADAR2能够相互结合;ADAR2在胃癌组织中的低表达,且ADAR2通过抑制胃癌细胞的增殖、迁移、侵袭以及促进胃癌细胞的凋亡影响胃癌的发生发展。第三部分LINC02535与ADAR2共同调控p53信号通路影响胃癌发生的分子机制目的:探究LINC02535与ADAR2相互作用如何共同调控p53信号通路影响胃癌发生方法:通过KEGG数据库分析p53信号通路表达差异相关基因。进一步通过荧光定量PCR实验检测LINC02535干扰细胞株与ADAR2过表达细胞株中这些差异基因的表达变化。并在胃癌肿瘤组织和正常组织中再次确认这些基因的表达变化差异。结果:KEGG数据库分析结果显示p53信号通路中有8个表达显著差异基因(BID、RRM2、CDK1、CCNB1、CCNE2、CHEK1、CCNB2、GTSE1)表达上调,2个表达显著差异基因(GADD45B和RPRM)表达下调。荧光定量PCR实验显示,与对照组相比,LINC02535干扰细胞株与ADAR2过表达细胞株中,基因BID、RRM2、CDK1、CCNB1、CCNE2、CHEK1、CCNB2、GTSE1 表达都明显被抑制,而基因GADD45B和RPRM表达明显增加。在胃癌肿瘤组织中,这10个基因的表达变化趋势与KEGG分析结果一致。结论:LINC02535与ADAR2共同调控p53信号通路影响胃低分化腺癌的发生。
其他文献
作为妇科中的一种致命性强、恶性程度高的肿瘤,卵巢癌在全世界范围内每年已经造成大约有12.5万人死亡。特别是针对晚期卵巢癌而言,约30%的初次诊断后,患者仅仅只有5年的存活率。确诊就是晚期,70%晚期患者是造成卵巢癌的高死亡率的一个主要原因;另一部分重要原因在于,其中有大量病人都普遍发生对化疗药物的耐药性。因此,靶向治疗分子的筛选与研发以及通过靶向药物增强卵巢癌对化疗的敏感性是目前亟待解决科研和临床
学位
目的:急性肝功能衰竭(acute liver failure,ALF)是由急性肝细胞大量坏死引起的一种严重致死性肝病,其发生发展受到一系列因子的复杂调控。近年来,越来越多的研究报道,微小RNA(microRNA,miRNA)在包括ALF在内的多种肝脏疾病的发生与发展中起着关键性的作用。因此,明确miRNA在ALF中的功能和作用机制,有助于阐明ALF的发病过程,对于寻找治疗ALF的新靶点具有着潜在的
学位
背景:FBXO45是F-box蛋白家族的成员,据报道与多种疾病的进展有关。然而,它在食管癌中的作用仍不清楚。方法:利用公开资料分析FBXO45的表达、临床特征、基因功能、途径以及不同免疫细胞浸润之间的相关性。用TIMER2数据库评估FBXO45在肿瘤组织中的表达。利用UALCAN数据库分析FBXO45在不同肿瘤分期和组织学亚型中的表达。采用STRING数据库构造了蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网
学位
第一部分 贻贝类生物仿生肽的合成及在多种骨科植入材料表面的改性应用目的:合成可生物正交的贻贝生物仿生肽,并研究其在多种固体材料表面改性中的应用可能。方法:基于标准的芴甲氧羰酰的固相肽合成策略合成含有二苯并环辛炔(Dibenzocyclooctyne,DBCO)功能团的贻贝生物仿生肽DOPA4-DBCO。在各种固体材料的表面,如聚苯乙烯片(制作细胞培养皿的材料)、玻璃片、不锈钢片及骨科临床常用的钛金
学位
研究背景:胸腺上皮肿瘤(Thymic epithelial tumors,TET)是一种来自于胸腺上皮细胞的不太常见的肿瘤,以上皮细胞的异常性过度增殖为主要特性,在所有恶性肿瘤中的发生率为0.2%至1.5%。世界卫生组织(World Health Organization,WHO)将TET分为胸腺瘤(thymomas,TM)和胸腺癌(thymic carcinomas,TC)。研究者据上皮细胞的形
学位
PET/CT显像已广泛用于乳腺癌的诊断、分期、治疗及疗效评价等,但多限于常规单次显像。显像剂18F-FDG不是肿瘤特异性显像剂,一些炎症病变也可不同程度摄取18F-FDG,并且有研究表明肿瘤细胞对18F-FDG的摄取也与其微血管密度、组织学分化程度及病理类型等因素相关。所以,常规单次显像可能会低估病变对18F-FDG的摄取能力,采用双时相显像技术可在一定程度解决这一问题,目前有关双时相显像对乳腺癌
学位
变质细碎屑岩型金矿床是世界上重要的金矿床类型,目前国内已发现了百余个变质细碎屑岩型金矿床。辽东地区是变质细碎屑岩型金矿床主要分布区之一。辽东地区经历了古元古代裂谷期、吕梁期以及印支-燕山期构造-岩浆作用,并不同程度伴随有成矿作用。区内赋存变质细碎屑岩型金矿床的含金建造经历了多期地质作用,其中古元古代裂谷发育晚期阶段在粘土质-半粘土质细碎屑岩建造中形成了含金建造,盖县岩组、盖县岩组与大石桥岩组三段四
学位
糖萼是由蛋白聚糖和糖蛋白等物质组成的细胞表面覆盖物,脓毒症时可出现糖萼的降解和破坏。脓毒症导致急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome,ARDS)的机制非常复杂,对糖萼在其中所起的作用和机制的研究有限,有动物研究显示糖萼破坏可能加重脓毒症导致的急性肺损伤。本研究拟通过临床试验探讨脓毒症ARDS患者内皮糖萼破坏与炎症反应和肺水肿的关系;拟通过动物实验
学位
第一部分维生素D缺乏小鼠卵巢组织的微小RNA测序分析目的维生素D不仅与骨骼的生长发育有关,而且与许多其他病理状况密切相关,本研究拟寻找维生素D缺乏引起生殖系统紊乱的主要生物学过程以及信号通路,以探索维生素D在调节女性生殖系统中的相关作用机制。方法1.建立维生素D缺乏小鼠模型;2.ELISA 检测小鼠血清中 25 羟基维生素 D3(25 hydroxyvitamin D3,25,(OH)D3)、雌二
学位
研究背景:肺癌是最常见的恶性肿瘤之一,其中80%以上为非小细胞肺癌(Non-small cell lung cancer,NSCLC),其中又以肺腺癌(Lung adenocarcinoma,LUAD)最常见;由于早期特异性症状较少,经常会导致延误诊治;肺癌早期切除率仅为20%左右,术后远期复发率为50%,5年中位生存率仅为10%左右。LncRNA(Long non-coding RNA,lncR
学位