【摘 要】
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第一部分肝母细胞瘤可能相关基因的鉴定与筛选目的本研究旨在系统性研究肝母细胞瘤的基因特征,并通过生物信息学方法鉴定与筛选出可能与肝母细胞瘤发生发展相关的基因。方法GSE131329和GSE81928均来自基因表达综合数据库。应用R软件Limma软件包对肝母细胞瘤与正常肝组织差异表达基因进行分析,并用加权基因相关网络分析对2组基因网络特征的相似性进行分析,Cytoscape用于可视化和选择关键基因。关
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第一部分肝母细胞瘤可能相关基因的鉴定与筛选目的本研究旨在系统性研究肝母细胞瘤的基因特征,并通过生物信息学方法鉴定与筛选出可能与肝母细胞瘤发生发展相关的基因。方法GSE131329和GSE81928均来自基因表达综合数据库。应用R软件Limma软件包对肝母细胞瘤与正常肝组织差异表达基因进行分析,并用加权基因相关网络分析对2组基因网络特征的相似性进行分析,Cytoscape用于可视化和选择关键基因。关键基因蛋白质相互作用网络由Cytoscape进行可视化。利用ClueGO对关键基因进行功能富集和通路分析,由Cytoscape进行通路信号互作网络分析。应用随机森林模型,以关键基因为特征,GSE131329数据集为训练集,构建肝母细胞瘤诊断分类器,并用GSE81928数据集验证诊断分类器可靠性。通过随机森林模型2个最重要预测变量的方法,进一步筛选出与HB可能相关的关键基因。将进一步筛选的关键基因与InnateDB数据库交叉验证,以确定核心基因。并应用实时定量PCR技术对人肝母细胞瘤标本和正常肝组织标本进行了核心基因验证。结果共筛选出4244个差异基因。加权基因相关网络分析确定出4个与疾病状态显著相关基因模块。筛选4个基因模块中节点排名前20位的基因,共获得114个关键基因。114个关键基因组成的蛋白质相互作用网络包含6982个关系对和3700个节点。对关键基因功能富集、通路和通路互作网络分析主要集中在丝裂原活化蛋白激酶、细胞周期、p53和其他与肝母细胞瘤相关的重要通路。以114个关键基因为特征基因,构建一个随机森林分类器,对肝母细胞瘤和正常样本进行分类时,真阳性率为95.5%,独立数据集GSE81928验证随机森林模型的分类效率为81.4%。通过随机森林模型的平均精确率减少值和平均基尼指数减少值,进一步筛选出35个关键基因。最后,通过与InnateDB数据库的交叉比较,最终确定CDK1、TOP2A、ADRA1A、FANCI、XRCC1、TPX2、CCNB2、CDK4、GLYATL1 和 CFHR3 共 10个核心基因。通过实时定量PCR技术验证,10个核心基因在肝母细胞瘤和正常肝组织表达趋势与数据库筛选基本相符。结论本研究建立了一个肝母细胞瘤随机森林分类器,并识别10个核心基因。研究发现的基因可能与肝母细胞瘤的发生发展相关,这些发现可能为肝母细胞瘤进一步研究提供思路。第二部分肝母细胞瘤术后早期并发症的危险因素分析目的探索及分析肝母细胞瘤患儿术后总并发症及常见并发症的危险因素。方法收集并回顾性分析首都儿科研究所附属儿童医院普外新生儿外科自2015年5月1日至2020年12月31日期间接受肝部分切除手术治疗患儿的临床及病理资料。对影响HB患儿术后总并发症及常见并发症发生的危险因素进行χ2检验、独立样本t检验、非参数检验和二元Logistic回归分析。结果1.全组277例患儿,其中男性167例,女性110例,年龄范围0.242-13岁（中位数为2岁）;发生术后并发症93例（33.6%）,其中胆漏41例,肺部感染29例,术后出血24例。2.单因素分析显示未发现肺部感染明显的危险因素;3.PRETEXT分期,肿瘤部位,病理类型,切缘,肝内多发病灶,血管侵犯,合并症共8个单因素与肝母细胞瘤患儿术后出血发生有统计学意义;4.二元Logistic回归分析显示,肿瘤位于右肝（OR=0.736,95%CI,0.558-0.971,P=0.045）,小细胞未分化型（OR=2.626,95%CI,1.479-4.665,P=0.048）,血管侵犯（OR=0.748,95%CI,0.610-0.917,P=0.036）,以及合并症（OR=1.326,95%CI,1.167-1.506,P=0.047）是 HB 患儿术后并发症发生的独立危险因素;5.血管侵犯（OR=0.534,95%CI,0.370-0.769,P=0.01）是HB患儿术后发生胆漏的独立危险因素。结论1.肿瘤位于右肝、病理类型为小细胞未分化型、存在血管侵犯及术前合并症的患儿发生术后并发症的风险较高;2.存在血管侵犯的患儿术后发生胆漏的风险较高;3.PRETEXT分期、肿瘤部位、病理类型、切缘、肝内多发病灶、存在血管侵犯及存在合并症可能与术后出血有关。
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