【摘 要】
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[目的]:分析Cf DNA中突变靶基因和TMB与局部晚期食管鳞癌同步放化疗近期疗效的相关性,进一步探索局部晚期食管鳞癌同步放化疗敏感性相关基因。。[方法]:以2017年4月至2018年4月在我院放疗科首诊行根治性同步放化疗的31例存在不可手术因素的局部晚期食管鳞癌患者作为研究对象,采用基于NovaSeq6000高通量测序平台的目标基因捕获测序技术检测Cf DNA中靶基因变异与肿瘤负荷变化,并用生物
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[目的]:分析Cf DNA中突变靶基因和TMB与局部晚期食管鳞癌同步放化疗近期疗效的相关性,进一步探索局部晚期食管鳞癌同步放化疗敏感性相关基因。。[方法]:以2017年4月至2018年4月在我院放疗科首诊行根治性同步放化疗的31例存在不可手术因素的局部晚期食管鳞癌患者作为研究对象,采用基于NovaSeq6000高通量测序平台的目标基因捕获测序技术检测Cf DNA中靶基因变异与肿瘤负荷变化,并用生物基因组学软件自动化分析测序数据,最后综合生物信息学和临床资料分析放化疗敏感组（CR+PR）A组和放化疗抗拒组（NR/SD+PD）B组两组间的基因突变和TMB差异。[结果]:在所有入组患者中,存活16例（51.6%）,失访0例（0%）,死亡15例（48.4%）,其中,13例患者死于原发肿瘤,1例死于治疗后副反应,1例死于吃中草药引起的肝衰竭。全组患者的中位生存时间（Median survival time,MST）未达到,1年和2两年OS分别为77.4%和51.6%,1年和2年的PFS分别为61.3%和35.5%。全组患者血浆样本Cf DNA突变频率10%以上的肿瘤相关基因为TP53、NOTCH1、BRAF、FGFR4、CDKN2A、ATRX 和AXIN2,其基因突变频率分别为 32%、19%、16%、16%、10%、10%和10%,以上7个基因在A组和B组均有分布且没有差异。高频突变基因主要与7条信号通路相关,主要涉及凋亡信号通路和细胞周期信号通路等,它们主要参与的是RTK-RAS信号通路。A组患者TMB值显著高于B组,但GXYLT1和KRT18基因在放化疗抵抗组患者的突变率显著高于放化疗敏感组。[结论]:TP53、NOTCH1、BRAF、FGFR4、CDKN2A、ATRX和 AXIN2 是食管鳞癌高频突变基因,其中TP53、NOTCH1和CDKN2A之间的联系较为紧密;KRT18和GXYLT1可能是放化疗抵抗基因;血浆Cf DNA中TMB可能能够作为预判患者同步放化疗疗效的标志物。
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