利用植物产生具有抑藻活性的次级代谢物去控制赤潮的发生,是一种有效的生物防治方法。海菖蒲（Enhalus acoroides）是一种很常见的海草,体型大,寿命长,覆盖面积大,广泛分布于我国东南沿海一带。本研究采用海菖蒲和赤潮藻球形棕囊藻（Phaeocystis globosa）为实验生物,观测海菖蒲水提液对球形棕囊藻的抑制效果,测定藻细胞的密度、叶绿素a含量以及最大光量子产率（Fv/Fm）等指标,用透射电子显微镜观察海菖蒲水提液对藻细胞亚显微结构的影响。再用超高效液相色谱-高分辨质谱联用（UPLC-HRMS）鉴定海菖蒲水提液的化学成分,并且结合液相色谱-串联质谱联用（LC-MS/MS）非靶向代谢组学方法进一步探明抑藻机制。（1）结果表明,海菖蒲水提液能够显著抑制球形棕囊藻的生长,96h抑制率可达98.02%,并且减少藻细胞的叶绿素a含量,降低光合系统Ⅱ原初光能转化效率。海菖蒲水提液会改变球形棕囊藻细胞超微结构,使藻细胞质壁分离液泡化、细胞器受损,最后细胞膜破碎内容物流出,藻细胞死亡。（2）采用UPLC-HRMS鉴定出了其中12个主要的化学成分,其中6种为黄酮类化合物。典型的黄酮类化合物木犀草素-7-O-葡萄糖醛酸苷,其对球形棕囊藻的EC_50-96h为34.29μg/m L,具有显著的抑制活性。（3）为进一步探究其对球形棕囊藻的抑藻机理,采用LC-MS/MS探究球形棕囊藻在用木犀草素-7-O-葡萄糖醛酸苷处理后,胞内和胞外代谢组的变化。结果表明,球形棕囊藻胞内代谢组水平有显著差异,而胞外没有显著的差异。抑藻化合物使细胞内木犀草素、没食子酸、甜菜碱和3种脂肪酸的含量增加,而参与三羧酸循环的α-酮戊二酸和乙酰辅酶a、谷氨酸和11种有机酸的含量下降。木犀草素的含量在处理组中显著增加,并且木犀草素对球形棕囊藻有较强的抑制作用,说明木犀草素在此抑藻机制中发挥十分重要的作用。α-酮戊二酸和乙酰辅酶a是含量下降的最显著的代谢产物,说明抑藻化合物通过干扰藻细胞的三羧酸循环从而抑制藻细胞的生长。本文阐明了海菖蒲产生的抑藻活性物质木犀草素-7-O-葡萄糖醛酸苷可以有效控制有害藻类球形棕囊藻的生长,并且具有很好的应用潜能。