整合GWAS和eQTL数据对肺癌潜在致病基因的识别

来源 :中国医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:nolva
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肺癌是全世界癌症死亡的主要原因。全基因组关联研究GWAS已经识别45个与肺癌相关的易感性位点,然而这些位点上的单核苷酸多态性SNP只能解释肺癌的部分遗传性。这些关联下潜在的分子机制很大程度上还是未知。目前对肺癌发病机制存在一个普遍认可的科学假设:这些SNPs可能通过调节其临近基因的表达从而发挥作用。本研究的目的是基于已公开发表的肺癌GWAS数据集,包含欧洲人群11348例肺癌和15861对照,与两组人类正常肺组织大规模的表达数量性状位点eQTL数据集整合,以发现可能通过基因表达对肺癌易感性具有因果效应的基因。Meta分析合并了来自1111人研究和GTEx项目公开的正常肺组织cis-eQTL数据集的汇总数据,利用两样本孟德尔随机化的方法,整合来自欧洲人群的正常肺组织cis-eQTL汇总数据与来自欧洲人群的肺癌及其组织学亚型(腺癌和鳞状细胞癌)GWAS汇总数据进行分析,并发现肺癌与其组织学亚型间共享的5个候选致病基因,分别是PRPF18,DTNBP,CBX8,ATG12和EPHX2。研究结果支持了基因表达与肺癌易感性之前潜在的因果关系。对候选基因的进一步探索将继续为肺癌的病因学提供新的见解。
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目的:本研究的目的是收集和分析我院术后病理确诊的肺结节的患者资料,找寻可以用来鉴别诊断肺良恶性结节的CT影像特征,分析这些影像特征与肺结节良恶性的关系,从而提高肺癌的早期诊断率并降低误诊率。方法:本研究是一项回顾性病例对照研究,研究对象为中国医科大学辽宁省人民医院2018年1月至2021年1月间接受肺结节切除手术的患者。回顾性分析病灶的CT影像学特征,包括肿瘤大小、位置、边缘毛糙、分叶征、毛刺征、
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