类风湿性关节炎（Rheumatoid arthritis,RA）是一种慢性全身性的自身免疫性疾病,临床表现为滑膜细胞增生、血管翳形成以及关节软骨和骨破坏。RA患者的滑膜细胞在缺氧和低营养的封闭炎症环境中诱变为成纤维样滑膜细胞（Fibroblast-like synoviocytes,FLS）,成纤维样滑膜细胞作为滑膜炎的主要组成细胞,它的侵袭和抗凋亡特性,调节免疫反应和慢性炎症的能力,最终使它成为类风湿关节炎的主要参与者。已有研究表明雷公藤红素（Celastrol,CEL）具有抗炎和抗癌的作用,其具体机制尚未完全清晰。本研究计划以RA患者FLS为研究对象,以CEL处理为实验组（High Dose,HD）,以DMSO处理为对照组（Control,Ctrl）,对HD组和Ctrl组分别进行RNA-Seq和Label-free,筛选出差异表达基因和差异表达蛋白,进一步筛选出显著差异表达基因和显著差异表达蛋白进行组学联合分析,对GO功能和Pathway途径富集分析,挑选6个候选基因,进行分子对接模拟、q RT-PCR和Western blot验证,探索CEL治疗RA的机制。本研究获得以下结果:1.对HD vs Ctrl的转录水平鉴定得到26565个表达基因,其中差异表达基因7803个,上调4479个,下调3324个;蛋白水平分析鉴定到3372个表达蛋白,差异表达蛋白共687个,357个上调,330个下调;其中一组样品中两次及以上不为空值,另一组所有数据均为空值的差异蛋白393个,169个上调,224个下调;其余部分的差异表达蛋白294个,其中106个上调,188个下调。2.当某一个蛋白被鉴定到且在转录组水平有表达信息时,则认为基因和蛋白被关联到。所有定量蛋白与关联的基因的相关性系数为0.2067,显著差异蛋白与关联的显著差异基因的相关性系数为0.2507,说明转录本与其关联的蛋白质表达一致性并不高。3.本研究采用转录组学和蛋白组学联合分析的方法来研究CEL治疗类风湿关节炎机制,共得到1897个关联上的差异表达基因,在蛋白质水平和转录组均无显著差异的基因有1254个,均有显著差异的基因有80个（转录水平和蛋白水平均上调的有36个;均下调的有15个;转录水平下调蛋白水平上调的27个;转录水平上调蛋白水平下调的2个）;仅在蛋白质水平有显著差异的基因有103个;仅在转录组水平有显著差异的基因有460个。4.从关联上的80个显著差异基因的蛋白中筛选已有晶体结构的蛋白,挑选6个,与CEL进行分子对接模拟,验证分子层面CEL与候选蛋白可以相互作用,揭示CEL与候选蛋白的结合能、结合方式和最佳结合位置,用于后续CEL活性结构修饰。5.对候选基因进行q RT-PCR验证,仅ANXA6（p=0.0013）和THBS1（p=0.0077）显著差异表达,使得候选基因的目标范围进一步缩小。6.对候选基因ANXA6的蛋白进行Western blot验证,结果表明相对于Ctrl组,HD组ANXA6的蛋白表达量明显上调。本研究探索了CEL对RA-FLS凋亡作用的分子机制,为RA的靶向治疗提供了一定的理论依据。通过对转录组和蛋白组联合分析筛选出来的关键蛋白,验证后获得的靶蛋白Annexin A6,为Annexin A6在CEL治疗RA的机制奠定基础。