预算作为一种系统的管理方法,用来分配高等学校的财务、实物及人力等资源,不仅可以用来监控战略目标的实施进度,更有利于控制开支。由于高等学校财务预算未能与绩效评价有机结合,预算与决算脱节,形成了目前高校预算、决算“两层皮”状况。因此对高等学校预算进行绩效评价,提高高等学校预算管理水平,不仅对高等学校自身改进办学实践具有指导意义,而且能使政府对教育工作的决策更加科学化。本文基于委托-代理理论、资源依赖理论,在国内外已有的研究成果上,结合高等学校自身的特点,构建了财务预算绩效评价体系；从高等学校投入、产出、效率、持续性4方面研究了高等学校财务预算执行绩效,即预算营运效果和效率,并对指标按照教学、科研、产业进行分类,以适应单项评价的需要；利用专家评定法和层次分析法进行了指标权重的设置；利用教育部直属高等学校的财务报表数据进行实例分析并提出加强高等学校预算管理的建议和措施。通过实例分析表明,本文构建的高等学校财务预算绩效评价体系具有可操作性,对高等学校预算执行绩效评价工作具有一定参考价值,对高等学校提高预算管理水平有一定的借鉴意义。