利用KASP标记定位小麦中国春无芒位点Awn-4A.1

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作为世界上最重要的粮食作物之一,小麦(Triticum aestivum L.)经历了一系列漫长的驯化过程。芒作为小麦穗部重要的光合器官之一,是小麦长期进化和适应环境的产物,对小麦产量和逆境适应均有重要意义。为了探究芒的发育及芒长的遗传机制,本研究以小麦无芒品种中国春(Chinese Spring,CS)为父本,有芒品系MK147为母本构建了F2分离群体和F5代重组自交系(RIL)群体,对其中的芒长抑制基因进行遗传分析和QTL定位,相关研究结果如下:体视显微镜观察幼穗发育结果表明,双亲小麦在雌雄蕊分化期,芒原基均开始出现;但在药隔分化期,双亲的芒原基则出现发育上的差异,即MK147的芒原基开始伸长生长,而CS的芒原基几乎不变。由此表明,CS无芒的表型是由于芒原基在药隔分化期不伸长导致的。对CS与MK147的后代群体进行遗传分析发现,F1代全部表现为有芒,芒长介于两亲本之间。F2群体芒长卡方分析表明,无芒单株和有芒单株符合1:3的分离比,RIL群体芒长卡方分析表明,无芒单株和有芒单株符合1:1的分离比,表明CS中无芒性状由半显性单基因控制。采用Wheat660K SNP芯片结合集群分离分析法(Bulked segregate analysis,BSA),在F2群体构建的无芒、有芒极端混池中,检测到一个多态性SNP标记的富集区域,初步将QTL定位于4A染色体。在该QTL区间共设计开发了58个KASP标记,最终将定位区间缩小至KASP标记SNP-1537与SNP-4195之间,遗传距离为0.81c M,对应于中国春参考基因组4A染色体上9.23 Mb(4A:100.56-109.79Mb,IWGSC.Ref.V1.0)的区间,并将该位点命名为Awn-4A.1。本研究为小麦芒长抑制基因的克隆,芒形成的遗传机制研究及分子标记辅助选择育种提供了重要参考。
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