玉米是我国以及世界上重要的粮饲兼用作物,但其产量和品质经常遭受到各种非生物胁迫的影响,特别是近年来频繁发生的极端高温给玉米的农业生产造成了极大的影响,已成为导致玉米产量和品质降低的主要逆境因子之一。近年来的研究发现,lncRNA和miRNA等非编码RNA分子在非生物胁迫响应过程中具有重要的作用,但是对于非编码RNA分子在高温胁迫应答过程中的分子调控机制尤其对于其遗传调控网络仍不清楚。本研究以玉米自交系CM1为材料,基于高通量测序技术对高温胁迫响应的lncRNA和miRNA进行筛选并鉴定其调控的关键靶基因。在此基础上,构建玉米耐热的遗传调控网络,从而为揭示玉米耐热的分子调控机制奠定重要的基础,取得的主要研究结果如下:1.以玉米自交系CM1为材料,通过高通量测序和筛选,共鉴定出53249个lncRNA,包括259个已知的lncRNA和52990个新lncRNA,其中95.56%为lincRNA 类型、1.97%为 antisenselncRNA 类型以及 2.47%的 introniclncRNA。2.对lncRNA和mRNA的表达以及结构特点进行了比较,发现鉴定的lncRNA表达量总体显著低于mRNA,在外显子数量和转录本长度上也有较大差异。通过差异表达分析,共鉴定了 993个差异表达的lncRNA（其中570个上调,423个表达下调）以及13160个差异表达mRNA转录本（其中8950个表达上调,4210个表达下调）。3.对差异表达的lncRNA分别进行了顺式和反式调控靶基因的鉴定,最后共分别获得956个顺式和8927个反式差异表达的靶基因,对顺式和反式共有的953个差异表达靶基因进行了 GO和KEGG富集分析,发现了一些可能与热胁迫应答有关的生物学通路。4.通过sRNA测序共鉴定了 340个miRNA,其中215个为已知的miRNA属于40个家族,长度为21nt的序列最为丰富。同时,鉴定了 125个新miRNA。5.鉴定了 35个差异表达的miRNA,其中21个表达上调,14个表达为下调。差异表达miRNA中,已知miRNA的表达量总体高于新miRNA成员。6.降解组测序共鉴定到115个miRNA的174个靶基因,转录因子家族为主要的类型,差异表达miRNA中共有17个成员鉴定到靶基因。7.基于lncRNA和miRNA的相互调控关系以及关键靶基因的富集结果,构建了玉米自交系CM1耐热的遗传调控网络,为进一步揭示玉米耐热的分子调控机制奠定了重要基础,同时为耐高温玉米新种质的创建提供了新思路。