基于胃癌ceRNA网络寻找生物标志物及免疫浸润分析

来源 :绍兴文理学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lbsylh
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
胃癌是最常见的消化道恶性肿瘤,造成了全球重大的经济与社会负担。胃癌的预防、发病机制、治疗以及预后都值得进一步研究。非编码RAN在胃癌的发生发展中发挥着重要作用,尤其是长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和微小RNA(micro RNA,miRNA)相互作用影响。目的:研究胃癌相关的lncRNA与miRNA相互作用及竞争性结合以调控下游mRNA的关系网络,构建lncRNA相关的胃癌预后模型并探讨胃癌的免疫微环境。方法:从TCGA数据库下载胃癌相关的表达数据,分析其差异表达。将差异表达的lncRNA与miRNA进行对比获取相应的关系对,构建竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络。进一步分析与生存相关的lncRNA,构建与胃癌相关的lncRNA预后模型。同时分析高风险组和低风险组在免疫细胞浸润与免疫检查点等方面之间的差异。最后使用实时定量PCR实验对相应的lncRNA在细胞及组织水平进行了验证。结果:首先我们构建了一个含有32个mRNA,90个lncRNA,33个miRNA的ceRNA网络。然后基于ceRNA网络中lncRNA的单因素cox生存分析结果,构建了一个含有14个lncRNA预后模型。该模型的风险评分是生存的独立预后指标,而且预测胃癌预后方面优于传统的临床病理学特征。此外,高风险组和低风险组在免疫细胞浸润与免疫检查点等方面之间存在显著差异。最后,我们验证了lncRNA ADAMTS9-AS1在细胞及组织层面的表达情况,发现在胃癌细胞株及胃癌组织中低表达。结论:研究获取了胃癌ceRNA调控网络,此网络为胃癌发生的机制提供了参考意见。胃癌的预后模型可以预测胃癌的预后并提供治疗靶点。
其他文献
沈从文在回顾自己的文学创作时曾经谈到个人的“创作激情源于内在的童心幻想”,可见“童心”是沈从文文学创作的重要因素,更是揭示沈从文文学创作独特性的关键指向。以“童心”观照沈从文的文学创作,可细致分化出童心的三种类型:自然童心,“异化”童心,诗性童心。自然童心是孩童气质在沈从文作品中的初步显现。首先是从作家创作层面进行分析,具体表现为沈从文创作时注重感官、直觉,想象的感性体验方式,由此形成文本印象化与
学位
李寄,一作李介,字介立,号因庵,明清之际江阴遗民诗人。李寄的诗文作品是明清之际遗民文学的重要组成部分,而他本人在明清之际的江阴乃至东南文坛的地位也应得到正确评价。本文拟从李寄的生平经历与诗文创作入手,结合现有李寄研究成果,考据李寄的生平和交游,分析其诗歌的精神世界和艺术特色,力图客观评价李寄及其文学创作在文学史上的地位和影响。全文分为六个部分。绪论部分梳理李寄研究的现状,阐明本文的研究意义和研究方
学位
纵观海飞的谍战创作,故事情节与精神内涵都渗透着对日常生活的描摹与理解。因此,海飞的谍战创作有别于以往小说对谍战传奇性、革命性的单方面强调,而是将日常生活经验融于谍战,使得隐秘谍战呈现出柔软的生活质地,平淡的日常生活也因谍战而波澜起伏,具有谍战与日常生活交织并重的书写特质。基于此,海飞借助小说中非日常的谍战与日常化的世俗生活之间的矛盾、冲突与融合,表达他对生活、革命、人性与战争的理解与诠释。一定程度
学位
本论文以张燕昌与飞白书研究为题,分为五个部分进行探讨。首先,第一部分梳理了张燕昌的生平。重点对张燕昌与翁方纲以及其师丁敬、张廷济的交游情况进行简要分析与阐述。第二部分以飞白书为论点。作为在历史上流行的一种书体,历代对其的研究更是延续至今。本章节从两方面入手,一方面论及其源流、阐述了飞与白的关系、飞白的运笔法、书写材料等工具的影响,同时谈及飞白书与普通书体、渴笔、散隶、草书以及双钩的区别,通过本章节
学位
1970年代初出生的鲁敏既拥有刻骨铭心的乡村生活记忆,又有着丰富的都市生活经验,鲁敏的成长主题小说表现出与众不同的成长叙事。她笔下的成长主人公通常镌刻了原生家庭和社会历史环境的双重印记,可以说,鲁敏成长主题小说不仅蕴含了一代乡土少年的成长经验,也记录了欲望化时代对成长者的精神冲击。因此,考察鲁敏成长主题小说,可以加深我们对于转型时代“成长”现象及与之相关的社会历史变迁的认知。文章首先厘清了成长小说
学位
多溴联苯醚(PBDEs)因具有独特的阻燃效果被广泛添加使用,致使其在环境中分布较广,对环境和人类的健康造成了严重的影响。因此,迫切需要一种有效且环境友好的方法来降解广泛分布在环境中的PBDEs,防止其对环境造成威胁。PBDEs的溴原子是导致其高毒性、高稳定性和难以被氧化的主要原因,有效地脱溴能够显著降低溴代有机物的毒性和稳定性,提高其可降解性。本文研究了采用两种不同的方式活化C-Br键降解十溴联苯
学位
本文将主要围绕《淳化阁帖》与《宣和书谱》为中心展开,通过分析比较《淳化阁帖》与《宣和书谱》选帖范围、选帖偏好、评价方法等的共通与差异,梳理出北宋草书发展过程中对唐人草书的接受与转变之脉络。探讨北宋时期草书批评的观念演进,并分析其中的原因。从时代环境、推动者的政治意图、对书法发展的独特价值等角度探究对《淳化阁帖》与《宣和书谱》的产生背景、原因及书法史地位。其次整理两者收录草书的偏好,从中窥得两者对于
学位
富锂锰基层状氧化物[x Li2MnO3·(1-x)Li MO2(M=Ni、Co、Mn,0<x<1)]具有大于250 m Ah g-1的高比容量,并且成本适中,因此备受关注。然而,富锂锰基层状氧化物(LMRO)存在首次库伦效率低、倍率性能差、循环稳定性不佳等缺陷,限制其商业化应用。本论文通过表面处理和表面包覆对富锂锰基氧化物进行修饰,研究其对材料电化学性能的影响:一、采用NH4F对Li1.2Mn0.
学位
目前,燃料和化学品主要来自不可再生且储量有限的石化资源。随着石化资源的日益枯竭和碳排放的严格限制,寻找可再生、可持续的燃料和化学品来源是当今化学发展的趋势。生物质来源丰富,是唯一的可再生碳源,其中,糠醛和短链醇是可以大规模制备的生物质平台分子,可制备一系列高附加值化学品。但当前报道的糠醛和醇的增值化反应催化体系,仍存在着催化剂易失活,副反应产物难以控制和催化转化路径不够明确等问题。为解决上述问题,
学位
随着我国工业的迅猛发展,随之而来的是环境污染的问题,其中,重(准)金属因素占据比例大,且具有降解难、易富集等特点。纳米FeS比表面积大,是一种良好的吸附剂,但它尺寸小,导致其在水溶液中易发生团聚,限制了它在污染治理中的应用。本论文将纳米FeS负载在氧化石墨烯(GO)、金属有机骨架材料(MOF)、六方氮化硼(h-BN)表面,制备得到GO/FeS、MOF/FeS、h-BN/FeS三种复合材料,解决纳米
学位