2017年中央一号文件指出，强化科技创新驱动，引领现代农业加快发展需要整合科技创新资源，不断加强农业科技研发，加快农业供给侧结构性改革，提高农业科技资源的配置效率与配置能力。农业科技的发展离不开农业科技资源的支撑，而农业科技资源的配置结构对其配置效率与配置能力有着较大的影响，如何优化农业科技资源的配置结构，提高农业科技资源的配置效率与配置能力以解决农业科技资源分散、重复、利用效率低等问题已成为农业科技领域关注的焦点之一。基于此，本文以农业科研机构为主要研究对象，辅之以各区域农业科研机构—省级农业科学院为例，对其配置结构、配置能力进行分析。通过构建农业科技资源配置系统模型，研究农业科技资源配置结构变化对农业科技产出的影响演化趋势；通过运用突变级数法以及NRCA模型对各省级农业科研机构科技资源配置能力以及比较优势进行分析，为提高农业科技资源配置效率、农业科技资源配置能力以及相关决策提供一定的理论参考和政策借鉴。　　本研究主要包括以下五个部分：　　第一部分，通过对科技资源及配置结构研究现状进行评述、对相关概念进行描述、相关理论进行阐述，从农业科技的人力资源、财力、信息资源三方面阐述农业科技资源配置体系的基本概念框架；通过对不同的配置主体的分析，构建以农业科研机构为主要配置主体的科技资源配置体系的理论分析模型，分析其科技资源配置结构的差异。　　第二部分，对科技资源的配置现状进行分析，梳理我国农业科研机构与的投入结构，将农业科研机构科技资源配置过程视作一个复杂的动态适应系统，运用因果关系图研究科技资源投入产出的因果逻辑关系，通过系统动力学理论与方法，构建我国农业科研机构科技资源配置结构的动态仿真模型，为配置结构动态模拟提供理论准备与数据支持。　　第三部分，在构建了我国农业科研机构科技资源配置结构的动态仿真模型之后，进行农业科研机构科技资源配置结构变动的效应实验，采用Vensim-DSS软件对其进行仿真模拟，通过对模型中科技资源投入结构的调整来观察科技产出的变动情况，通过对可能的各种方案进行反复试验，从而找到农业科研机构科技资源优化配置的方案。　　第四部分，基于省级农业科学院视角，对我国各区域最主要的农业科研机构的科技资源配置能力进行分析，运用突变级数法计算其科技资源配置能力；运用标准显示性比较优势指数（NRCA）定量评价其科技资源利用的比较优势，以此为我国省级农业科研机构科技资源配置能力的提升提供有针对性的政策建议。　　第五部分，对仿真模拟出的配置方案进行最优分析，探讨投入结构的变动差异，得出部分结论，通过对其配置结构的组合仿真结果，结合对各省农业科研机构科技资源配置能力的测算以及对比较优势的研究，提出有针对性的政策建议。在提出相应的政策建议之后，对不足之处进行了剖析，对进一步研究提出了可行性设想。