近几年，虽然各种运输方式得到快速的发展，但是它们过于强调自身利益而不考虑整体效益，导致了运输方式之间发展不协调，结构失衡比较严重，严重制约着综合运输体系的进一步发展。 　　综合交通运输系统所涉及到的环境特别复杂，是一个非线性动态的复杂巨系统。针对该系统越来越复杂这一问题，现有的管理理论和方法已经表现出了局限性，所以这就要以全新的角度去研究综合交通运输系统这一问题。本文以C AS理论的视角来研究综合交通运输系统，是一个全新的角度，综合运用C AS理论、治理理论和综合运输理论，对综合运输系统的复杂适应性，该系统利益主体之间复杂作用的运作机制，以及如何实现各种运输方式的整体最优化进行了研究，为构建综合交通运输体系提供理论和实践性的指导。 　　论文的主要研究内容如下： 　　第一、本文基于C AS理论，从分析该系统复杂适应性入手，明确了综合交通运输系统中的利益主体，重点研究了高速铁路、高速公路和航空三个利益主体之间的冲突与协作行为，并分析了该系统的影响因素。 　　第二、对综合交通运输系统的演化进行了研究，这里包括构建各主体刺激——反应模型，主体适应性学习和多主体协同进化。首先探索各主体微观行为规则，然后研究主体适应性学习机制，最后对多主体协同进化的实质和最终达成的目标进行了研究。根据以上研究，构建了综合交通运输系统多主体协调模型，并加以验证。该模型研究各个主体之间的最优结构，为合理调整运输结构，提高运输效率，又好又快的实现综合交通运输系统协同进化提供了依据；并以京沪线，北京至上海段为例，对高速铁路、高速公路、民航三种运输方式的客运交通结构进行优化配置。 　　第三、根据模型分析结果，建立制衡综合交通运输系统不同主体间的利益冲突的治理机制。这里面包括系统多主体动力优化机制，综合运输体系政策机制，综合交通运输系统多主体利益协调机制以及完善综合交通运输体系研究机制。