中医药传统知识是我们整个民族长期以来与疾病进行斗争实践取得的成果,是历代医者们经验与智慧的结晶。一直以来,在面对疑难杂症、防治未病以及养生保健等各个方面中医药都显示着自身独有的价值与优势,应当说中医药当属于我国优势领域。近些年来,以化学成分为基础的西药逐渐显示出其不足,许多国外制药企业纷纷开始将目光投注于我国传统中医药,尤其以中药方剂为突出。国外药企通过合作、低价收购或直接利用等手段获取我国中药方剂资源,并利用自身资金以及技术上的优势在在我国中药方剂之上进行二次开发并为自己申请专利保护,造成我国大量中药方剂资源的流失。由此,维护我国中药方剂乃至整个中医药领域的知识产权显得尤其重要。但当前,围绕中医药领域的知识产权保护主要是以专利制度为核心的,而我国传统中药方剂又因其自身的独特性难以与专利审查体系相契合,与西药相比,中药方剂领域的专利授权率往往都极低,难以获得有效保护。那么如何有效防止中药方剂资源的流失,如何在现有知识产权体系下保护和促进我国中医药事业的发展,这是值得认真探索和研究的。因此,本文将首先对作为法律保护对象的中药方剂进行概述,在厘清中药方剂概念及相关概念的基础上,着重分析中药方剂独特性及其法律保护范畴;然后,通过相关数据着重分析现有专利保护和中药品种保护对中药方剂保护的现状,分析二者的保护范围及存在的不足,并在此基础上对比分析使用商业秘密保护机制保护中药方剂的优势性,分析其保护的可行性;紧接着介绍分析国外发达国家和发展中国家保护传统医药的相关实践,并结合我国中药方剂的具体情况进行对比分析,总结出其对我国中药方剂保护的启示;最后,结合我国具体问题和国外相关实践的启示对中药方剂适用商业秘密保护提出具体的对策,分别从科学界定中药方剂商业秘密、侵权行为认定、权利限制、中医药企业内部商业秘密管理以及商业秘密机制与其他制度的协调保护几个方面提出针对性建议,以期为我国中药方剂保护工作提供些许可行性参考。