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跨膜蛋白(transmembrane protein)与细胞外配体相互作用在生物过程(如信号转导和运输)中具有重要意义。跨膜蛋白的多功能性使它们成为理想的药物作用靶点。尽管膜蛋白结晶技术取得了巨大进步,目前膜蛋白与配体共结晶结构的数量仍然有限。本研究以典型的跨膜蛋白包括转运蛋白(transporters)和G蛋白偶联受体(GPCRs)为对象,通过设计整合一套计算机模拟的工作流程,针对跨膜蛋白结构构建、重要小分子药物与靶点的结合模式/解离路径预测和药物选择性机制等与药物设计密切相关的科学问题开展了系统深入的研究。