分子标记分型错误及发生率评价、控制方案——以微卫星DNA为例

来源 :第十次全国畜禽遗传标记研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wangbp20021225
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基因分型错误已成为目前分子标记检测(如痕量样品分析、法医学鉴定)过程中愈发受到重视的问题.本文以微卫星DNA标汜检测为例,对分型错误的可能来源、错误发生率评价及其控制方案进行综述分析,为类似研究工作提供参考.
其他文献
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通过DNA测序,对浙江温岭高峰牛MHC-DRB3基因exon2多态性进行研究,共检测到63种复等位基因,其中32种新复等位基因.基因频率的范围从0.078~0.009,R-07的基因频率最高为0.078,其次为R-01和R-155,均为0.043,最低的基因频率为0.009.复等位基因间多态位点68个,统计分析表明,非同义替换率(dN)高于同义替换率(dS),抗原结合位点编码序列的dN与dS差异极
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本文利用PCR-SSCP技术对113头郏县红牛CLPG基因的多态性进行了分析.发现有三个等位基因A、B、C,他们的基因频率分别为0.8673,0.0619和0.0708.仅发现AA、AB和AC三种基因型,频率分别为0.7345,0.1239,0.1416.群体的杂合度(Hk),有效等位基因数(Ne)、多态信息含量(PIC)分别为0.2389,1.1331和0.2256.该位点处于Hardy-Wei
本研究克隆测序了牦牛HSP72基因的全序列.利用一系列的生物信息学软件分析了该基因的结构、密码子偏好性和HSP72蛋白的氨基酸组成.结果表明:牦牛的HSP72基因序列全长为1926bp,无内含子,共编码641个氨基酸;牦牛的HSP72基因和HSP72蛋白的氨基酸序列与普通牛、猪、人相比存在着一定差异,这可能是导致他们之间对温度适应性差异的主要原因之一.
利用5个微卫星基因座BM1818、BM143、BM1443、BM1905、BM711对90头河北荷斯坦母牛进行了遗传检测.用非变性(中性)聚丙烯酰胺凝胶电泳检测微卫星的PCR扩增产物.结果表明BM1818、BM143、BM1443、BM1905、BM711的等位基因数/多态信息含量/有效等位基因数/杂合度分别为5/0.618/3.096/0.677、7/0.727/4.202/0.762、5/0.
为了建立牛精子蛋白的分离技术路线,对牛精子细胞裂解方法、双向电泳条件等进行了摸索,结果发现采用尿素-盐酸胍两步裂解法裂解精子细胞制备蛋白,并使用13cm非线性胶条进行蛋白二维电泳,能取得较好的实验结果.图谱经二维电泳软件分析,可检测出约800多个蛋白质点.对精子蛋白双向电泳条件的摸索,为后续牛精子特异性蛋白的检测和分析奠定了基础.
采用聚丙烯酰胺凝胶电泳对28头松辽黑猪的前白蛋白1(Pa1)、后白蛋白1(Po1)、后白蛋白2(Po2)、转铁蛋白(Tf)、淀粉酶1(Am1)、淀粉酶2(Am2)、碱性磷酸酶(Akp)、血液结合素(Hpx)9个基因位点的多态性进行检测.运用线性模型对这9个蛋白位点多态性与 生产性能的关系进行了分析,结果在在体高、体长、胸围、胴体直长、皮厚、大理石花纹、眼肌面积、瘦肉率、背膘、熟肉率、失水率等性状上
以13/17罗伯逊易位纯合子猪[2n=36,XY或XX,rob(13;17)]为实验材料,制备其有丝分裂中期染色体,利用显微分离技术时13/17罗伯逊易位染色体进行分离,并将单条染色体进行LA-PCR扩增,其扩增片段大小主要在0.2-2.2kb之间;对LA-PCR扩增产物用猪13、17号染色体近着丝点微卫星标记SWR1941和SWR1120与Southern杂交两种方法进行鉴定,结果表明LA-PC
解耦联蛋白家族(uncoupling proteins,UCPs)是线粒体内膜的转运蛋白,具有解离氧化磷酸化耦联的功能,影响机体能量代谢.本研究通过PGR和PCR-SSCP等方法,对UCP3基因进行多态性扫描并进行测序验证,在UCP3基因所扫描的区段中共发现并验证了6个多态性位点,然后对这6个多态性位点进行转录因子结合位点预测,结果表明,有4个突变位点改变了转录因子结合方式,对这4个多态性位点进行