草鱼胆固醇合成酶FDFT1、FDPS、SC5DL、LSS基因的克隆及组织表达分析

来源 :第九届世界华人鱼虾营养学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wx9033016
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  在草鱼肠道转录组测序(RNA-Seq)结果基础上,以草鱼肠道粘膜组织为材料,采用RT-PCR技术克隆草鱼胆固醇合成酶FDFT1、FDPS、SC5DL、LSS的基因片段,运用DANMAN软件进行片段序列的氨基酸推导和氨基酸同源性分析,结果显示:草鱼FDFT1、FDPS、SC5DL、LSS基因片段长分别为786、886、951、1230bp,分别编码260、294、301、409个氨基酸的蛋白。四种胆固醇合成酶的氨基酸序列与斑马鱼相对应的氨基酸序列的相似度分别为93%、92%、91%、93%。采用半定量RT-PCR分析各胆固醇合成酶相关基因在草鱼肝胰脏、肠道中的表达情况,结果表明:四个基因在草鱼肝胰脏和肠道组织均有表达,而表达活性有一定的差异,肝胰脏以FDPS、LSS和SC5DL表达为主,肠道以FDFT1、FDPS、LSS和SC5DL表达为主。本实验获得了草鱼胆固醇合成酶FDFT1、FDPS、SC5DL、LSS的基因序列片段。
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