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采用ISSR分子标记技术对孑遗植物水松(Glyptostrobus pensilis)的8个种群共112个体的遗传多样性水平和遗传结构进行了研究.结果表明,同其他濒危裸子植物相比,水松在物种水平和种群间都具有较低的遗传多样性.不同种群间存在一定程度的遗传分化,UPGMA聚类分析反映出水松种群遗传距离与地理距离存在正相关性.水松自然种群遗传多样性及遗传变异明显高于人工种群.基于水松种群遗传学和生态学的研究结果,提出应加大对遗传多样性高的水松种群保护力度,加强水松种群间基因交流,以最大限度地保存水松资源的遗传多样性.