肿瘤纯度相关论文
DNA甲基化几乎与所有类型的癌细胞和基因组区域异常有关,识别与肿瘤相关的差异甲基化位点可作为肿瘤纯度的估算指标,进而评估样本......
肿瘤组织中除了肿瘤细胞之外还有免疫细胞、基质细胞、间质细胞等非肿瘤细胞,共同影响肿瘤发生发展.肿瘤纯度与肿瘤患者临床特征、......
拷贝数变异是结构变异的主要类别,它的发现极大地改变了我们对个体差异的理解。拷贝数变异主要表现为DNA片段的缺失和重复,长度在5......
本文主要研究两组肿瘤样本的差异甲基化位点检测问题。DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰,在细胞过程(包括基因调节,发育和疾病)......
背景肿瘤组织的体细胞突变(Somatic Mutation)检测通常是指基于全基因组或全外显子组高通量测序数据,对肿瘤细胞中相对于背景基因......
肿瘤组织中除了肿瘤细胞之外还有免疫细胞、基质细胞、间质细胞等非肿瘤细胞,共同影响肿瘤发生发展。肿瘤纯度与肿瘤患者临床特征......
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目的研究骨肉瘤中上皮间质转化(EMT)相关基因的来源及与患者生存预后的关系。方法从Gene Expression Omnibus数据库中获得3个独立......
在癌症基因组学研究中,临床所得的肿瘤组织是由癌症和正常细胞组成的混合物,肿瘤不纯会对后续的数据分析产生严重影响。基于DNA甲......
肿瘤纯度是肿瘤样本的固有属性之一,它可能对多种类型的肿瘤数据分析问题产生严重的影响。我们之前开发了统计方法InfiniumPurify,......
肿瘤与正常细胞的差异基因表达分析、肿瘤的亚型识别都对癌症的早期诊断和临床治疗具有非常重要的意义。然而,临床上获得的肿瘤组......
针对肿瘤组织中正常细胞的混入对差异表达产生不利影响的问题,构建了肿瘤样本基因表达的混合概率模型,通过广义最小二乘模型和Wald......
随着近年来二代测序的快速发展,许多检测算法被证明可以用来识别基因组结构变异,基因组结构变异的仿真和符合真实测序特性的序列的......
肿瘤纯度精确与否会影响大部分表观遗传学的研究结果,甚至会改变现有的生物学解释。由于在表观遗传机制中,DNA甲基化数据获取容易......
