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皖南浅变质岩地区由四个不同构造单元拼合而成。中元古早期皖南为一古岛弧；约1000Ma前，华南板块沿江山-绍兴一带俯冲，是岛弧向扬子板块增生；约900Ma前左右，皖南沿祁门-三阳坑一带产生弧后扩张盆地；而850Ma前，华夏古陆沿江山-绍兴一带与扬子板块对接拼合，弧后盆地被动俯冲结束，标志增生的完成，同时深部发生重熔，形成初生陆壳改造型（S型）花岗岩类侵人体，如休宁、许村、歙县等岩体；约780Ma，华南洋壳的俯冲使洋盆逐渐缩小，华南板块和扬子板块发生碰撞，以至祁门-三阳海盆关闭，形成祁门-三阳坑陆壳碰撞地缝合