【摘 要】
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目的采用生物信息分析技术探讨胶质瘤（Glioma）差异表达基因筛选、功能富集和相关信号通路。方法在基因表达谱数据库（GEO）中选取胶质瘤中相关基因表达谱芯片数据，采用R软件lima包筛选胶质瘤患者肿瘤组织和正常脑组织中差异表达基因。对筛选出的差异表达基因进行功能富集（GO和KEGG），应用采用蛋白-蛋白相互作用数据库（STRING）分析筛选出的差异表达基因编码蛋白间的相互作用关系，分析相关信号通路
【机 构】
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河南省人民医院神经外科 郑州大学人民医院 河南大学医学院，郑州 450000,河南省人民医院神经外科 郑州大学人民医院 河南大学医学院，郑州 450000,河南省人民医院神经外科 郑州大学人民医院 河
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目的采用生物信息分析技术探讨胶质瘤（Glioma）差异表达基因筛选、功能富集和相关信号通路。
方法在基因表达谱数据库（GEO）中选取胶质瘤中相关基因表达谱芯片数据，采用R软件lima包筛选胶质瘤患者肿瘤组织和正常脑组织中差异表达基因。对筛选出的差异表达基因进行功能富集（GO和KEGG），应用采用蛋白-蛋白相互作用数据库（STRING）分析筛选出的差异表达基因编码蛋白间的相互作用关系，分析相关信号通路。
结果选取GSE15824和GSE66354基因表达谱数据集为分析对象，筛选出差异表达超过2倍，且P<0.05的基因158个。158个差异基因主要分子功能（MF）为整合素结合、细胞黏附分子结合、钙离子结合及AMPA谷氨酸受体活性等；细胞组分定位（CC）于细胞膜、神经元细胞体及神经细胞轴突等，而其生物学过程（BP）主要为细胞黏附、神经系统发育、细胞增殖、GTP酶活性、细胞凋亡和血管生成等；KEGG信号通路主要为cAMP信号通路、嘌呤代谢通路、MAPK信号通路及cGMP-PKG信号通路，158个差异表达基因蛋白相互作用网络中相互作用连接共177个，平均每个节点间相互作用为2.39个，聚集系数为0.37。Cytohubb筛选信号通路中的关键基因（hub基因），结果提示，SLC6A1、SLC1A2、BDNF、CAP43、NRXN1、GAD1、OLIG2、PLP1、S100B和GRIA3为相互作用蛋白网络信号通路中的关键基因。10个关键基因均与患者预后有关（P<0.05）。
结论胶质瘤患者肿瘤组织和正常组织存在差异表达基因谱，SLC6A1、SLC1A2、BDNF、GAP43、NRXN1、GAD1、OLIG2、PLP1、S100B和GRIA3为胶质瘤发生的关键基因并与患者的预后有关。
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