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本研究旨在从DNA水平揭示四川、重庆和贵州地区山羊的母系起源和群体遗传特征．通过对川渝黔地区13个山羊品种（类群）共152个体或序列mtDNAD-loop高变区HV1片段（481bp）变异的分析，结合13个山羊参考序列（分属于A、B、C、D、F和G单倍群）构建系统进化树和单倍型网络分析以及不同单倍群群体扩张分析，结果表明：152只山羊mtDNAD-loopHVI序列被类聚为A和B两个单倍群，其中单倍群B又分化为B1和B2两亚单倍群．从2种单倍群的地理分布特征可以发现，北川白山羊和阿坝藏山羊全部属于单倍群A