基于GenBank分析28S(D2/D3)、18S和ITS序列作为根结线虫条形码标记的适用性

来源 :南京农业大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sun18903827600
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基于GenBank中根结线虫属的核酸序列,筛选了28S(D2/D3)、18S和ITS3个不同的序列片段,利用遗传距离法和分子系统学方法评价其各自作为根结线虫条形码标记的可行性。结果显示:28S(D2/D3)、18S及ITS的核酸序列种内平均遗传距离分别为0.0043、0.0027和0.024,种间平均遗传距离分别为0.074、0.036和0.156,由于属内近缘种的影响,各分子标记的种内、种间遗传距离均有一定的重叠;基于K2P模型构建的3种分子标记NJ系统发育树显示,南方根结线虫、爪哇根结线虫、花生根结线
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