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对两个通过遗传图谱构建定位的马氏珠母贝（Pinctada ucata）生长性状相关的QTL在两个不同群体中进行验证分析。结果显示：QTL471489在深圳群体中与壳高、壳宽显著相关（P〈0.05）,其CT基因型个体的壳高、壳宽和体质量显著大于CC基因型,CT为优势基因型;而在杂交群体中该QTL与生长性状关联不显著（P〉0.05）,但CT基因型的生长性状值仍最大。QTL410206在深圳群体中与生长性状关联不显著（P〉0.05）,而在杂交群体中该QTL与壳高、壳长、壳宽和体质量显著相关（P〈0.05）,AA