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串联补偿电容器的存在，使得高压输电串补线路阻抗出现非连续性，对目前广泛采用的继电保护原理产生影响。以750kV电压等级的串补输电线路为模型，用EMTP仿真建模，给出了最小二乘矩阵束法分析线路故障后电流信号中的自由分量分布以及衰减情况，得到串补输电线路的故障特征。仿真结果表明，利用最小二乘矩阵束法可以在故障后快速识别出信号频率及相应的衰减时间常数，给出保护安装处实际感受到的谐波变化情况。该方法适合于暂态谐波分析，为分析故障暂态对保护的影响提供一定的指导意义。