Identification of HOXA10 target genes in human endometrial stromal cells by RNA-seq analysis

来源 :生物化学与生物物理学报(英文版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:bailong08
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Homeobox A10(HOXA10)is a transcription factor belonging to the homeobox gene family.It is highly expressed in endometrial stromal cells(ESCs)and plays essential roles in the prolifera-tion and differentiation of endometrium,the establishment of endometrial receptivity and embryo implantation.However,little is known about the target genes and signaling pathways regulated by HOXA10 in ESCs.In this study,we identified 1830 transcripts regulated by HOXA10 in ESCs by RNA interference(RNAi)and RNA-sequencing(RNA-seq)analysis,of which 980 were posi-tively regulated by HOXA10 and 850 were negatively regulated by HOXA10.Interestingly,matrix metallopeptidase-11 was downregulated by HOXA10 in stromal cells verified by quantitative real-time polymerase chain reaction and western blot analysis.Pathway analysis demonstrated that the target genes were enriched in various pathways,including cellular metabolism,DNA replica-tion and repair,cell junction,and lysosome and signal transduction.The results of the present study provide novel insights into the mechanism underlying HOXA10 regulation in ESCs and may identify novel targets for the diagnosis and treatment of endometrium-related infertility.
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