【摘 要】
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生物分类学的发展濒临危机，与其理论自身的困境不无关系。生物分类学运用归纳方法，以部分代表性特征解释整体种群、以特征对比解释系统发育的研究模式，自然导致其带有一种还原论
【基金项目】
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教育部人文社会科学研究规划基金项目“中国科研诚信建设现状的社会学分析与对策研究”(12YJAZH089)
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生物分类学的发展濒临危机，与其理论自身的困境不无关系。生物分类学运用归纳方法，以部分代表性特征解释整体种群、以特征对比解释系统发育的研究模式，自然导致其带有一种还原论的特性。这一特性与生物学的整体论思想之间存在着某种紧张关系，造成了分类学发展的内部困境。不同的生物分类学派在存在论、认识论与方法论三个层面表现出不同的还原论或整体论倾向。系统生物学在相当程度上实现了还原论与整体论的融合，为生物分类学走出理论困境带来了曙光。
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