我国Colti病毒基因分型的研究

来源 :中华实验和临床病毒学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:onepiece_bing
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目的 对我国分离的Colti病毒进行基因分型。方法 采用针对Colti病毒B2亚组第9和12片段和B1亚组第12片段的3对引物,对我国近年来分离的Colti病毒利用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法进行基因分型。同时对北京分离株BJ95-75和云南分离株YN-6的PCR产物进行了克隆测序及同源性分析。结果 Colti病毒北京分离株BJ95-75、云南分离株YN-6、-67-1、-68-1、-69、-70-1、-70-2、-90、-92-2、-93病毒用B2亚组特异引物12-854-S/12-B2-R均能得到相对分子质量为850 bp的特异条带,用针对于第9片段的B2亚组引物9-JKT-S/9-JKT-R均得到了相对分子质量为492 bp的特异条带。而Colti病毒东北分离株NE97-12、NE97-31及对照病毒如环状病毒YN-99、乙脑病毒YN-151-1未能扩出特异条带。所有Colti病毒分离株及病毒对照用B1亚组特异引物12-B1-S/12-B1-R均未见特异条带。BJ95-75、YN-6这2株病毒第12片段核苷酸序列与B2亚组其他毒株间的同源性达到89.4%以上,特别是与中国早期分离株Banna病毒,其同源性达到98.9%以上;2株病毒第9片段的核苷酸序列与属于B2a型的Banna病毒的同源性可达到99.2%和96.5%,和JKT6423病毒的同源性也能达到84.0%,而与属于B2b型的JKT6969和JKT7043相应片段核苷酸序列的同源性只有53.0%左右。结论 首次对我国分
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