【摘 要】
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目的从全基因组关联研究(GWAS)发现的与2型糖尿病(T2DM)发病风险相关的单核苷酸基因多态性(SNP)位点中,筛选出可用于预测妊娠期糖尿病(GDM)女性产后出现T2DM的SNP。方法利用2
【机 构】
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天津市妇女儿童保健中心项目办公室; 首都儿科研究所流行病学研究室; 北京协和医学院研究生院; 天津医科大学肿瘤医院肿瘤研究所流行病与卫生统计室; 美国路易斯安娜
【基金项目】
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国家自然科学基金(81502821)
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目的从全基因组关联研究(GWAS)发现的与2型糖尿病(T2DM)发病风险相关的单核苷酸基因多态性(SNP)位点中,筛选出可用于预测妊娠期糖尿病(GDM)女性产后出现T2DM的SNP。方法利用2009—2010年天津市妊娠期糖尿病随机干预试验研究基线收集的1 240名GDM女性(80名T2DM和1 160名非T2DM)血样,检测并分析40个GWAS发现的与T2DM发病相关的SNP位点。基于单个SNP的遗传风险解释比例,结合产后T2DM的发生情况,联合采用ROC曲线下面积(AUC)、整合区分指数(IDI)及再分类净优化指数(NRI)进行候选SNP筛选。结果以遗传风险解释比例最大的SNP(rs10906115)为基础,依次纳入其他的SNP,共发现1个SNP可显著改善AUC(P=0.019),8个SNP可显著改善IDI(P <0.05),8个SNP可显著改善NRI(P <0.05)。综合所有40个GWAS发现的SNP位点对AUC、 IDI及NRI的改善情况,共有11个SNP(rs10906115, rs2779116, rs7034200,rs7041847,rs780094,rs5015480,rs11212617,rs831571,rs7944584,rs6815464,rs35767)可用于预测GDM女性产后发生T2DM的风险,同时11个SNP可累计解释5.5%的GDM女性产后发生T2DM的遗传风险。结论为避免资源浪费,建议在众多GWAS发现的与T2DM发病相关的SNP位点中,选择能够显著改善风险预测能力或风险再分类能力的11个SNP用于预测GDM女性产后发生T2DM的风险。
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