目的应用寡核苷酸芯片技术高通量分析Barrett食管与正常食管黏膜组织的基因表达差异，探索与疾病进展相关的靶基因。方法对Barrett食管患者的病变食管黏膜以及正常食管黏膜组织，应用Trizol一步法进行总RNA抽提，10g/L琼脂糖凝胶电泳和芯片实验室进行RNA质量检测。总RNA纯化后进行逆转录cRNA合成、荧光标记和纯化，将Barrett食管黏膜和正常食管黏膜组织的cRNA探针分别与Agilent寡核苷酸芯片（30，968探针）进行杂交，洗涤后应用Agilent扫描仪获取图像，Feature Extraction提取软件进行定量分析处理。结果（1）大活检钳钳取2次活检的组织能提供芯片所需要的5μg RNA，配对组织总RNA质量高，反转录cRNA及荧光标记质量好；（2）2倍差异表达基因中，上调基因共142个，下调基因共284个。其中包括bcl-2、MCLI、BAX、BIK和BCLAF1等15个异常表达的bcl-2家族相关基因。结论基因芯片分析可用于内镜下活检组织，Barrett食管的发生发展涉及多基因多步骤，是一个复杂的过程；bcl-2家族相关基因异常表达可能涉及Barrett食管的发生发展过程，确切机制有待进一步深入研究。