【摘 要】
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近年来，高通量测序技术（Next-generation sequencing, NGS）快速发展，已广泛应用于生命科学各个领域，但传统的混合细胞测序（Bulk cell sequencing）检测的是细胞群体的总平均反应，无法反应每个细胞的真实情况，这会影响研究者对细胞功能认知的准确性。单细胞测序技术（Single cell sequencing, sc-Seq）的出现，从一定程度上解决了传统测序
【基金项目】
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深圳市可持续发展专项（深科技创新[2020]180号，专2019N002）；
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近年来，高通量测序技术（Next-generation sequencing, NGS）快速发展，已广泛应用于生命科学各个领域，但传统的混合细胞测序（Bulk cell sequencing）检测的是细胞群体的总平均反应，无法反应每个细胞的真实情况，这会影响研究者对细胞功能认知的准确性。单细胞测序技术（Single cell sequencing, sc-Seq）的出现，从一定程度上解决了传统测序固有的缺陷。单细胞测序是针对单个细胞的RNA或DNA进行测序，能够准确测出单个细胞的基因结构和表达状态，从而分析相同表型细胞的异质性。本文首先介绍单细胞测序的原理、测序类型和测序平台，有助于理解单细胞测序和在进行科研项目时设计合适的项目方案。进一步介绍单细胞转录组测序的分析流程和各种常用的分析工具或软件，并重点阐述单细胞转录组测序分析中的细胞聚类和拟时序分析的原理和研究进展，为进行单细胞转录组测序数据分析提供参考。最后，本文简述了单细胞测序研究热度、单细胞测序的应用、挑战和展望等，有助于更全面地认识单细胞测序。
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