【摘 要】
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目的:基于网络药理学探究刺山柑治疗系统性硬化症(SSC)的分子机制.方法:使用GEO、GeneCards、PharmGkb、TTD以及DrugBank数据库获取SSC靶点,查阅相关文献及SwissTargetPrediction数据库获取刺山柑主要成分及其所对应靶点,取交集获取预测靶点.登录String数据库对预测靶点进行蛋白互作分析(PPI),进一步使用Cytoscape对网络拓扑分析获取核心基因,并将核心基因与刺山柑主要成分进行分子对接验证.使用R软件对预测靶点进行基因本体论(GO)分析和京都基因与基
【机 构】
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河南中医药大学,河南 郑州 450046;南阳理工学院张仲景国医国药学院,河南省张仲景方药与免疫调节重点实验室,河南 南阳 473004
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目的:基于网络药理学探究刺山柑治疗系统性硬化症(SSC)的分子机制.方法:使用GEO、GeneCards、PharmGkb、TTD以及DrugBank数据库获取SSC靶点,查阅相关文献及SwissTargetPrediction数据库获取刺山柑主要成分及其所对应靶点,取交集获取预测靶点.登录String数据库对预测靶点进行蛋白互作分析(PPI),进一步使用Cytoscape对网络拓扑分析获取核心基因,并将核心基因与刺山柑主要成分进行分子对接验证.使用R软件对预测靶点进行基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析.结果:共获取刺山柑有效成分15个及其靶点178个,SSC靶点3171个,取交集得到预测靶点66个.拓扑分析得到PPI核心基因VEGFA、TNF、AKT1、PTGS2、MMP9等10个,GO分析涉及活性氧代谢过程、蛋白激酶B信号、炎症反应的调节、磷脂酰肌醇3?激酶信号等多项生物过程,KEGG通路分析得到PI3K?Akt信号通路、蛋白聚糖与癌症、黏着斑、Rap1信号通路等信号通路.结论:通过网络药理学方法预测刺山柑治疗SSC的分子机制,为刺山柑治疗SSC的基础研究提供了理论依据和数据支撑.
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