基于矩阵分解技术的系统性红斑狼疮转录调控网络构建

来源 :河北师范大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:chen1052333209
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利用双向聚类方法提高系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)基因表达数据特征基因提取的有效性;预测SLE患病过程中转录因子活性以及对靶基因的调控强度变化,构建和挖掘与SLE发病密切相关的转录调控网络及其生物过程。利用FastICA方法进行双向聚类筛选出800个SLE显著基因,结合转录调控信息选取其中表达显著的转录因子及其靶基因,利用NCA预测SLE发病过程中转录因子活性以及对靶基因调控强度的变化,并构建调控网络。构建了由9个转录因子和47个靶基因所组成的调控网络,
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