【摘 要】
：
为确定rpoB、gyrA和cheA基因在芽孢杆菌近缘种鉴定上的有效性,通过Blast-N算法,比对菌肥常用芽孢杆菌模式菌16S rRNA、rpoB、gyrA、cheA基因的序列差异,确定其应用效力.据此,提出一种根据菌株原始信息选择对应的基因引物扩增其序列,通过序列相似度和系统发育树快速、准确鉴定芽孢杆菌菌种的方法,并以19株可用于微生物肥料生产的芽孢杆菌分离株为材料,验证该方法的可行性.结果显示:地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)与枯草芽孢杆菌亚种(Bacillus subti
【机 构】
：
华南农业大学 资源环境学院,广东 广州510642
论文部分内容阅读
为确定rpoB、gyrA和cheA基因在芽孢杆菌近缘种鉴定上的有效性,通过Blast-N算法,比对菌肥常用芽孢杆菌模式菌16S rRNA、rpoB、gyrA、cheA基因的序列差异,确定其应用效力.据此,提出一种根据菌株原始信息选择对应的基因引物扩增其序列,通过序列相似度和系统发育树快速、准确鉴定芽孢杆菌菌种的方法,并以19株可用于微生物肥料生产的芽孢杆菌分离株为材料,验证该方法的可行性.结果显示:地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)与枯草芽孢杆菌亚种(Bacillus subtilis subsp.subtilis、Bacillus subtilis subsp.inaquo-sorum、Bacillus subtilis subsp.spizizenii)、解淀粉芽孢杆菌亚种(Bacillus amyloliquefaciens、Bacillus velezensis)之间rpoB、gyrA、cheA基因序列的一致性分别为84.93％ ～86.57％、低于78.21％和78.25％ ～78.58％,枯草芽孢杆菌和解淀粉芽孢杆菌亚种之间gyrA基因序列的一致性为81.01％ ～95.82％,cheA基因序列的一致性为94.50％ ～95.83％,蜡样芽孢杆菌亚种(Bacillus cereus、Bacillus thuringiensis)之间gyrA基因序列的一致性为94.54％,巨大芽孢杆菌(Bacillus megaterium)和阿氏芽孢杆菌(Bacillus aryabhattai)cheA基因序列的一致性为94.55％.序列差异表明,rpoB、gyrA和cheA基因可以区分地衣芽孢杆菌、枯草芽孢杆菌组和解淀粉芽孢杆菌组,gyrA和cheA基因可以鉴定出枯草芽孢杆菌组、解淀粉芽孢杆菌组的亚种,gyrA基因能够鉴定蜡样芽孢杆菌组的亚种,cheA基因能区分巨大芽孢杆菌和阿氏芽孢杆菌.应用所提方法,将19株芽孢杆菌分离株鉴定为茹氏短芽孢杆菌(Brevibacillus reuszeri)、Bacillus mesonae、五大连池芽孢杆菌(Bacillus wudalianchiensis)、大猩猩芽孢杆菌(Bacillus massiliogorillae)、枯草芽孢杆菌枯草亚种(Bacillus subtilis subsp.subtilis)、蜡样芽孢杆菌、阿氏芽孢杆菌和贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis).
其他文献
通过持续监测2007—2019年设施黄瓜白粉病的田间流行动态,研究其田间流行规律并建立预测模型.结果表明,不同年份设施黄瓜白粉病盛发期时间总体较一致,春黄瓜、秋黄瓜发病最高峰分别为6月中旬、10月上旬;年度间的峰期持续时间、发生量差异较大,春黄瓜以2019年高峰期发病最重,秋黄瓜以2009年发病最重,2013年春黄瓜和秋黄瓜上均发病重但峰期持续时间短;该病的流行与气候条件密切相关,干湿交替频繁、冷暖起伏大的环境条件下发病重.在此基础上,根据该病害的田间系统调查资料及每年3—10月的气象因素,采用逐步回归分
为了解杜仲miR172家族成员的进化特征及其在杜仲生长发育过程中的作用.从杜仲小RNA高通量测序结果(登录号:SRP216820)及已发表文献中获取杜仲miR172家族前体和成熟体序列,进行序列比对、WebLogo保守性分析、系统发育树构建、前体茎环结构预测、启动子结构分析、靶基因预测及功能预测.结果表明,杜仲miR172家族共有8条前体和8条成熟体序列,且前体序列均能形成稳定的茎环结构;序列比对和WebLogo分析表明,除eu-miR172d-5p以外的其他7个成员的成熟体序列保守性较高,但前体序列的保
12月2日,省林业局局长胡侠主持召开2021年第十二次局长办公会议.会议传达学习省委十四届十次全会、省委常委会经济社会发展工作研究部署会、省委全面深化改革委员会第十七次会议精神.
为了探明克氏原螯虾(Procambarus clarkii)5—6月死亡的病因并制定相应的治疗方案,本试验从患病克氏原螯虾肝胰腺中分离到1株病原菌(L20190509),通过生理生化特征、16S rRNA序列分析和进化树进行鉴定,通过琼脂扩散法测定了该菌株的药物敏感性,进一步研究了抗菌药物与天然化合物的联合抑菌作用.结果发现,该菌株对克氏原螯虾的半数致死浓度为9.27×104 CFU·mL-1,其生理生化特征与雷氏普罗威登斯菌(Providencia rettgeri)一致,16S rRNA测序和进化树分
浙江清凉峰国家级自然保护区地处浙江省西北部,位于杭州市临安区境内,区内有吴越古道、徽杭古道、浙西天池、天龙峡谷、十门峡等徒步旅游景观,主峰清凉峰海拔1787.4米,系天目山脉最高峰,也是浙西第一高峰,有“浙西之巅”“浙西屋脊”之称.
采用不同浓度的碱性盐(NaHCO3)溶液对3年生夏蜡梅实生苗进行处理,从形态生长和离子运输途径分析夏蜡梅对碱性盐胁迫的响应机制,为夏蜡梅的合理开发利用提供理论指导.结果表明:夏蜡梅苗高、地径相对生长量、生物量以及根冠比均随着盐碱胁迫的加重而不同程度的减少;随着碱性盐浓度的增加,各器官中Na+含量均高于对照,其排序为:根>叶>茎;低浓度碱性盐胁迫下K+含量排序为:茎>根>叶,而高浓度胁迫下K+含量排序为:叶>茎>根;Ca2+含量排序为:叶>根>茎;夏蜡梅茎、叶中K+/Na+比值远大于根,叶中Ca2+/Na+
为果蔬斯高维尔炭疽菌检测提供高效便捷、特异性好、可视化的检测方法,以果蔬斯高维尔炭疽菌内部转录间隔区ITS序列为靶基因,设计4条LAMP引物和1条环引物,通过对引物比例、反应时间、反应体系等条件的选择,建立对果蔬斯高维尔炭疽菌具有特异性扩增的LAMP检测方法.特异性试验结果显示:所建立的LAMP反应体系在最佳反应温度65℃条件下扩增60 min,以果蔬斯高维尔炭疽菌DNA为模板的反应体系在指示剂钙黄绿素和羟基萘酚蓝的作用下,分别呈现绿色和蓝色,反应结果为阳性,扩增产物经2％琼脂糖凝胶电泳检测呈梯形条带;而
将模糊数学理论引入柑橘种植的土地适宜性评价中,以湖北省通山县为例,在当地的农用地中采集207个土壤样本点,将气候、土壤和地形数据转换为模糊隶属度数据,然后在ArcGIS软件环境中结合层次分析法和模糊数学方法,建立包含15项指标的柑橘种植土地适宜性评估模型.结果表明,该区域有26.94％(652.37 km2)、32.85％(795.51 km2)、23.14％(560.42 km2)和17.07％(413.40 km2)的土地分别非常适合、适中、勉强适合和不适合柑橘生产.研究结果与当地生产实际相吻合,说明
为探究新型的果蔬干燥前预处理工艺,提高干燥速率和干燥产品品质,采用真空脉动蒸汽烫漂预处理工艺,在热风真空组合干燥方式下对胡萝卜切片进行试验研究.分别进行蒸汽烫漂单因素试验和四元二次回归正交试验,通过响应面法分析烫漂温度、烫漂真空度、烫漂时间和循环次数与样品维生素(VC)含量、复水比、色差的关系,建立相应的数学模型,并对真空脉动蒸汽烫漂工艺参数进行优化.结果表明,烫漂强度的增加会对胡萝卜干制品中的VC造成一定的破坏,但却有利于复水.对工艺进行优化后,得到的最优参数为烫漂温度110℃,烫漂真空度0.08 MP
为探讨蛋黄比例、结冷胶和氯化钠添加量对复配蛋液凝胶性能的影响,通过单因素试验对凝胶质构特性(硬度、弹性、咀嚼性)、色差值和持水性进行评价;利用Box-Behnken响应面分析法,选取咀嚼性为评价指标建立回归方程得到最优添加量.结果表明,各因素对复配蛋液凝胶咀嚼性的影响顺序为蛋黄比例>结冷胶添加量>氯化钠添加量;复配蛋液最优配方为蛋黄比例64％、蛋清比例36％,另外添加结冷胶0.14％、氯化钠1.5％,此时复配蛋液凝胶的咀嚼性理论值为978.063,验证试验值为910.494.通过响应面优化配方,使蛋液的凝