病原菌感染斑马鱼胚胎差异表达基因的生物信息学分析研究

来源 :辽宁师范大学学报(自然科学版) | 被引量 : 0次 | 上传用户:clarain
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
为研究斑马鱼和病原菌之间的相互作用分子机制提供理论依据.以斑马鱼胚胎感染迟钝爱德华氏菌(Edwardsiella tarda)和鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimuri-um)的GEO表达谱数据库(GSE35474)为分析对象,利用R语言筛选出感染8 h后的差异表达基因,并对差异表达基因进行功能富集分析,构建蛋白质互作关系网络,筛选hub基因.斑马鱼胚胎受鼠伤寒沙门氏菌和迟钝爱德华氏菌侵染后,差异表达基因一共127个,GO功能富集和KEGG分析结果显示差异表达基因主要参与炎症反应和天然免疫反应过程,主要组成为细胞质和细胞外区域或空间,主要具有转录因子活性、序列特异性DNA结合、RNA聚合酶Ⅱ转录因子活性等分子功能.主要参与Toll样受体信号通路、JAK-STAT信号通道、MAPK信号通路等.通过蛋白质互作关系网络得到8个可能参与天然免疫过程的关键基因,分别是TNFα、TNFβ、SOCS、IRF1、STA T3、MMP9、FOS、NF-κB.
其他文献
针对无人机辅助通信网络频谱效率亟待提高的问题,提出了认知无人机网络的混合决策中继选择算法,构建切换容忍和时延容忍的设计方案.通过时延信息确定候选中继簇,使其具备最佳通信条件的节点,完成数据传输,获得中断概率性能的提升,解决阴影区域链路切换可靠性过低的问题.仿真结果表明:与传统单参数决策方案相比,在不同接入策略下其中断概率分别下降30%和33%.
以T2DM模型小鼠为研究对象,探讨其对T2DM小鼠的改善作用及机制.结果显示,葛根素能显著降低T2DM小鼠的血糖水平,能使T2DM小鼠损伤的胰腺组织得到很好的修复I.llumina和LC-MS结果显示,葛根素能显著改变T2DM小鼠肠道菌群的物种组成,改变T2DM粪便代谢物的含量和肠道基因的表达量.与DM组相比,Pue组小鼠肠道菌群的物种组成在门、目、属水平上均发生了显著的变化.与DM组相比,Pue组共筛选出505个差异显著代谢物,308个差异显著基因.经KEGG富集分析,代谢物5-羟基-L-色氨酸、褪黑素
探讨低位直肠癌手术中保留盆腔自主神经并行侧方淋巴结清扫的临床效果与安全性.以2019年3月~2020年12月到淮北市人民医院进行全直肠系膜切除(TME)手术的低位直肠癌患者60例为研究对象,根据术中是否行侧方淋巴结清扫(LLND)术分为观察组和对照组各30例,对照组患者行TME手术,观察组患者行TME+LLND手术,比较2组患者手术相关指标、炎症因子、排尿功能、性功能、1年复发率以及1年生存率等指标.观察组患者手术时间、术中出血量均高于对照组,差异有统计学意义(P0.05).直肠癌患者TME术后进行LLN
针对全球定位系统/北斗卫星导航系统/惯性导航系统(GPS/BDS/INS)深组合导航系统中卫星数量增加导致计算量迅速增加,难以满足高精度实时定位的问题,该文提出了一种基于星间差分的多星座GPS/BDS/INS深组合导航系统降维滤波方法.首先,通过星间差分消除时钟误差相关状态量,降低状态方程维数;然后,将滤波器分拆成多个子滤波器,通过分散估计、两步级联的方法减少计算量,即通过分散式组合方法(DIM)降低量测方程维数;最后,通过子滤波器的并行运行实现高精度实时定位需求.通过仿真实验对该文算法的定位精度和复杂度
借助扫描电子显微镜和显微硬度计等手段,研究了压缩变形与退火工艺对纯铜组织和性能的影响,获得了不同变形程度纯铜在不同退火条件下的组织演变和性能变化规律.研究结果表明:晶粒粗大的工业纯铜经室温压缩变形+退火可获得晶粒细小的组织.对于冷变形程度为40%的纯铜,最佳退火工艺为450℃×15 min;对于冷变形程度为80%的纯铜,最佳退火工艺为350℃×15 min,继续升高退火温度和延长保温时间都会使再结晶晶粒不断长大.与冷变形程度40%的纯铜试样相比,冷变形程度80%的纯铜试样退火后晶粒更细小.在本试验条件下,
采用JGP-300型超高真空磁控溅射镀膜设备在蓝宝石衬底上制备了Ga2 O3薄膜,研究了溅射功率和退火工艺对薄膜晶体结构、表面形貌和光学特性的影响.研究结果表明:当溅射功率为90 W时,Ga2 O3薄膜的(-402)衍射峰最强,薄膜结晶质量最好.退火后Ga2 O3薄膜的结晶度均有所加强.随着溅射功率的增加,Ga2 O3薄膜变得均匀致密,但溅射功率过高反而影响成膜质量.Ga2 O3薄膜吸收边在250 nm附近,在Ga2 O3可见光区域透过率可达85%以上,且在450~500 nm处接近100%.退火处理可以
研究基于危机管理理论的预防性护理对低体质量早产儿院内感染的控制效果.将2018年1月~2019年4月铜陵市立医院收治的低体质量早产儿纳入对照组(n=100),2019年5月~2020年11月该院收治的低体质量早产儿纳入观察组(n=100),对照组给予常规护理,观察组给予基于危机管理理论的预防性护理.比较两组早产儿医院感染发生率及感染部位,结果表明:观察组医院感染发生率为9.00%,明显低于对照组医院感染发生率21.00%(P0.05).基于危机管理理论的预防性护理能够有效控制低体质量早产儿院内感染发生率,
为了提高轮毂电机驱动汽车的纵横向稳定性,将汽车的横摆控制和防滑控制相结合,采用分层控制架构搭建纵向和横向稳定性联合控制模型.上层为力矩决策层.基于比例-积分-微分(PID)控制算法构建车辆纵向车速跟踪控制器;基于模糊P ID控制算法搭建驱动防滑控制器,采用前馈加反馈的控制方法决策出驱动防滑力矩;基于二阶滑模控制算法建立直接横摆力矩控制器,设计附加横摆力矩加权模块控制汽车的横摆特性.下层为力矩分配层.采用优化分配算法将上层决策出的总纵向力矩、驱动防滑力矩和直接横摆力矩合理地分配到4个车轮上.通过加速和转向联
以百度、搜狗和360指数作为我国居民冰雪运动网络关注度的数据来源,对冰雪运动网络关注度的时空特征进行研究.以“冰雪运动”为长尾关键词,借助于5118关键词挖掘工具对搜索引擎和社交平台进行挖掘,通过高频词共现网络矩阵和疑问词关联矩阵对我国居民冰雪运动网络关注度的热点分布进行研究.结果显示:①我国冰雪运动网络关注度具有明显的时间序列变化特征,呈现逐年增加趋势,存在明显季度和月度特征.季节变化、政策影响、重大赛事是影响我国冰雪运动网络关注度的时间序列变化的主要因素.②我国冰雪运动网络关注度在空间上存在明显差异,
为了解决传统花朵授粉算法收敛精度较低、易收敛到局部最优等问题,提出了融合动态收敛因子与黄金正弦的花朵授粉算法(DGSFPA).在异花授粉中引入动态收敛因子,来提高算法收敛精度.在自花授粉中进行黄金正弦优化,以增强跳出局部最优的能力.通过与其他3种算法在测试函数上的比较,验证了改进算法具有更高的收敛精度和更快的收敛速度.将DGSFPA应用于求解压力容器设计优化问题中,研究结果表明:改进算法所得4个设计变量值均比其他3种算法所得值小,且其总成本比花朵授粉算法减少5270.82元,比人工蜂群算法减少876.72