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剥蚀厚度估算是进行古构造特征研究、烃源岩热演化史模拟和古流体势分析的重要基础工作。根据焉耆盆地的地质特点和现有资料情况，首先在博湖坳陷选择了27口探井，利用泥岩声波时差法进行了单井地层剥蚀厚度估算；然后以这些数据为约束点，选择了10条地震剖面，利用地震剖面追踪法对整个博湖坳陷的侏罗系剥蚀厚度进行了估算。结果表明，在纵向上，侏罗系各组在白垩纪遭受了不同程度的剥蚀，剥蚀最严重的是上侏罗统，其次是中侏罗统头屯河组和西山窑组，下侏罗统三工河组和八道湾组保存相对完整；在横向上，博湖坳陷不同地区遭受的剥蚀程度不尽相同